RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 DHFR2Q86XF0 187 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RNF148Q8N7C7 305 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RBP7Q96R05 134 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 INIPQ9NRY2 104 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SNX13Q9Y5W8 968 aa6.93□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 AQP12BA6NM10 295 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 VGLL3A8MV65 326 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 CENPBD1B2RD01 187 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 H3BUI4 141 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 CCL24O00175 119 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 CXCR6O00574 342 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 GSTA4O15217 222 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 NR2C1P13056 603 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ETS2P15036 469 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 KDELR2P33947 212 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ACTR3P61158 418 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SCARB2Q14108 478 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 FLOT2Q14254 428 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 PCK2Q16822 640 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 DEFB136Q30KP8 78 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 C1orf146Q5VVC0 180 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 BBS10Q8TAM1 723 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 LRRC29Q8WV35 223 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 MAL2Q969L2 176 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLC35B4Q969S0 331 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RNFT2Q96EX2 444 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RAX2Q96IS3 184 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SEPHS2Q99611 448 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 C5orf58C9J3I9 102 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 M0QX08 132 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ARPC2O15144 300 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 DEDDO75618 318 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SERPINB7O75635 380 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 IFNA14P01570 189 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ARG1P05089 322 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 GGT2P36268 569 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 AQP2P41181 271 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLC34A1Q06495 639 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 KRT73Q86Y46 540 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF695Q8IW36 515 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 OSR2Q8N2R0 312 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 LNX2Q8N448 690 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 LRGUKQ96M69 825 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 POLE4Q9NR33 117 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 TPST1O60507 370 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 SELENOWP63302 87 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 PGAP1Q75T13 922 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 FAM162AQ96A26 154 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.9□□□□□ -1.3
SPCS1-202ENST00000423431 A0A1B0GWJ7 208 aa6.89□□□□□ -1.31
SPCS1-202ENST00000423431 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SPCS1-202ENST00000423431 H7C1C5 153 aa6.89□□□□□ -1.31
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