RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 ABCB10Q9NRK6 738 aa22.99■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 PITPNBP48739 271 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 MMP15P51511 669 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ZNF718Q3SXZ3 478 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 MTFR2Q6P444 385 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 C1QL2Q7Z5L3 287 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 RAB40AQ8WXH6 277 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ING4Q9UNL4 249 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 LDLRAD4O15165 306 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 SELEP16581 610 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 TUBG1P23258 451 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 GCH1P30793 250 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ATP1B3P54709 279 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 SSX8Q7RTT4 187 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 OR8H2Q8N162 312 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 HPSE2Q8WWQ2 592 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 TUBG2Q9NRH3 451 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 C14orf119Q9NWQ9 140 aa22.98■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 VSIG8P0DPA2 414 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 GPM6AP51674 278 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 CAPZA1P52907 286 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 IFITM3Q01628 133 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 CEACAM21Q3KPI0 293 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 VHLLQ6RSH7 139 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 KRT74Q7RTS7 529 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 BIVMQ86UB2 503 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 LRRC46Q96FV0 321 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 IQCF6A8MYZ5 107 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 TMEM225BP0DP42 221 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 CDK2P24941 298 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 PTAFRP25105 342 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 C1orf174Q8IYL3 243 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 S100A13Q99584 98 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 DPRXA6NFQ7 191 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 CTAG2O75638 210 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 UPK1BO75841 260 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 QRFPP83859 136 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 BSPH1Q075Z2 132 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 UNC119Q13432 240 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 SLC22A6Q4U2R8 563 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 LINC01560Q8TB33 94 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 ITPKCQ96DU7 683 aa22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MSX1-201ENST00000382723 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ZP1P60852 638 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 OR10K1Q8NGX5 313 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 OR5P3Q8WZ94 311 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 RNF170Q96K19 258 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ABHD1Q96SE0 405 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 PALMDQ9NP74 551 aa22.95■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 PQLC2LA1A4F0 135 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ZNF732B4DXR9 585 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ABCD4O14678 606 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ANGPTL7O43827 346 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ZG16O60844 167 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 BAK1Q16611 211 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 TMEM69Q5SWH9 247 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 GDPD1Q8N9F7 314 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 TMEM104Q8NE00 496 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 CCDC32Q9BV29 185 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 RAB22AQ9UL26 194 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 A0A1W2PP11 408 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 B8ZZF3 427 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 KDM4BO94953 1096 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 NAT2P11245 290 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 MSMPQ1L6U9 139 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 Q8N402 240 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 OR5A2Q8NGI9 324 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 OR8S1Q8NH09 359 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 PHF21AQ96BD5 680 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 BANF2Q9H503 90 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 NGBQ9NPG2 151 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 NDRG3Q9UGV2 375 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 DUSP13Q9UII6 198 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 CFAP46Q8IYW2 2715 aa22.94■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 TMEM14DPA8MWL7 114 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 UBBP0CG47 229 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 GLRXP35754 106 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 RANBP1P43487 201 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 ESPL1Q14674 2120 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 PYHIN1Q6K0P9 492 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 SLC22A25Q6T423 547 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 CALHM1Q8IU99 346 aa22.93■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 MPIG6BO95866 241 aa22.92■■□□□ 1.26
MSX1-201ENST00000382723 RAB6AP20340 208 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms