RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 FSTP19883 344 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MYL9P24844 172 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ACKR3P25106 362 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MAGEB1P43366 347 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 LSM3P62310 102 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PSG7Q13046 419 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MOGQ16653 247 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PARP16Q8N5Y8 322 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 KCTD7Q96MP8 289 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SHARPINQ9H0F6 387 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 DUSP13Q9UII6 198 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 FZR1Q9UM11 496 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CEPT1Q9Y6K0 416 aa13.58□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 A0A1W2PPK0 400 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 A0A1W2PPW3 197 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD61A6NGH8 418 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 E7EQL1 145 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 IGHV3-13P01766 116 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OR4A8P0C604 315 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PPP3R1P63098 170 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CLVS2Q5SYC1 327 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CYB5R2Q6BCY4 276 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 UTS2BQ765I0 119 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OR5AS1Q8N127 324 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MUC15Q8N387 334 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 FAM168AQ92567 244 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ISOC1Q96CN7 298 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 TECTBQ96PL2 329 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SYT3Q9BQG1 590 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CENPOQ9BU64 300 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CHST5Q9GZS9 411 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PLK3Q9H4B4 646 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NEK6Q9HC98 313 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 TCF7L1Q9HCS4 588 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 TAS2R4Q9NYW5 299 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 GPR160Q9UJ42 338 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SLC22A1O15245 554 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CST4P01036 141 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CSF3P09919 207 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 BMP4P12644 408 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 RAB3AP20336 220 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 THBS2P35442 1172 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ADIPOQQ15848 244 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 CTF1Q16619 201 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MSMPQ1L6U9 139 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ZNF525Q8N782 197 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OR8G5Q8NG78 346 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PIGCQ92535 297 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SLC22A4Q9H015 551 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ABCB9Q9NP78 766 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SNTG1Q9NSN8 517 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.56□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PLSCR5A0PG75 271 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 A6NHS1 94 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 A6NIN4 97 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 H7C417 338 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 HAX1O00165 279 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PDCD5O14737 125 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PIN1P1O15428 100 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SULT1B1O43704 296 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NRASP01111 189 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SRMP19623 302 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 SERPINF1P36955 418 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 EVX1P49640 407 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 VBP1P61758 197 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NCS1P62166 190 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PRDX4Q13162 271 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 NKPD1Q17RQ9 610 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 PLCXD3Q63HM9 321 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 TMEM42Q69YG0 159 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 KRT74Q7RTS7 529 aa13.55□□□□□ -0.24
IFT20-201ENST00000322326 LRP11Q86VZ4 500 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms