RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DXOO77932 396 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UTS2O95399 124 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 UBE2KP61086 200 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXK1P85037 733 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APCDD1LQ8NCL9 501 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 VWCEQ96DN2 955 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NDUFAF3Q9BU61 184 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SH3BGRL3Q9H299 93 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM206AQ9NX38 181 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.05■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SCGB1D2O95969 90 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ADH1BP00325 375 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TRGC1P0CF51 173 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CENPMQ9NSP4 180 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa20.04■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 IL33O95760 270 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNH1P13489 461 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SERPINA2P20848 420 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BCKDHBP21953 392 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC22A25Q6T423 547 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR8G5Q8NG78 346 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ABHD5Q8WTS1 349 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC25A31Q9H0C2 315 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BANF2Q9H503 90 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RBFOX3A6NFN3 312 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C9J4A7 227 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLDN4O14493 209 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYB5BO43169 146 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COX5BP10606 129 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ECI1P42126 302 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WASP42768 502 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GLIPR1P48060 266 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CASP6P55212 293 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF4P78317 190 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DLK1P80370 383 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NHLH2Q02577 135 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR8G1Q15617 311 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIST1H2BLQ99880 126 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SUCNR1Q9BXA5 334 aa20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RTL10Q7L3V2 364 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AVL9Q8NBF6 648 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCL4L1Q8NHW4 92 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF133Q8WVZ7 376 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FOXQ1Q9C009 403 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SMCO3A2RU48 225 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TGOLN2O43493 480 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MBPP02686 304 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRP19P09132 144 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FGF7P21781 194 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RNF144BQ7Z419 303 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FRZBQ92765 325 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WASF3Q9UPY6 502 aa20.02■□□□□ 0.8
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A0J9YY10 115 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 A0A1B0GV50 99 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DVL1O14640 695 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DNM1P34Q6PK57 102 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SPACA5Q96QH8 159 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF20P17024 532 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SEC13P55735 322 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C2orf27AQ580R0 203 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLXDC2Q6UX71 529 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SULF2Q8IWU5 870 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.01■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CCDC187A0A096LP49 1063 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PLPP3O14495 311 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CLPSP04118 112 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MYOGP15173 224 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HAGHQ16775 308 aa20■□□□□ 0.79
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CHRFAM7AQ494W8 412 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms