RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290378.4

ACTC1-201, Transcript of actin, alpha, cardiac muscle 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTC1, Length 4,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1-201ENST00000290378 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR52A1Q9UKL2 312 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 THBS1P07996 1170 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PDCD1Q15116 288 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM229BQ8NBD8 167 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 STT3BQ8TCJ2 826 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 NUDT9Q9BW91 350 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 KLK13Q9UKR3 277 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PLXNA3P51805 1871 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1B0GTQ1 180 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1W2PPC1 479 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PRR32B1ATL7 298 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 H3BP45 60 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TRGC2P03986 189 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TESK1Q15569 626 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 RAET1LQ5VY80 246 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CST9LP1Q5W188 147 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TERB2Q8NHR7 220 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 C4orf45Q96LM5 186 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 LYRM4Q9HD34 91 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CST7O76096 145 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 GNG10P50151 68 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 FMODQ06828 376 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 DMWDQ09019 674 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ACKR1Q16570 336 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR52N4Q8NGI2 321 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR5D14Q8NGL3 314 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ABHD6Q9BV23 337 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 A0A1W2PP11 408 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 E9PQ18 207 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 UBE2CO00762 179 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 HSPA12AO43301 675 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 UTS2O95399 124 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 SLC17A1Q14916 467 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 SGCBQ16585 318 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 HLA-BQ31612 363 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 LCN15Q6UWW0 184 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 FAM185AQ8N0U4 392 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ASB17Q8WXJ9 295 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MED29Q9NX70 200 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 GNG13Q9P2W3 67 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 RAB22AQ9UL26 194 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PGCP20142 388 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 KLK2P20151 261 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 HERV-K104P61576 105 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PKIAP61925 76 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MICBQ29980 383 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PIGTQ969N2 578 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM68Q96MH6 324 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 NICN1Q9BSH3 213 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 WWTR1Q9GZV5 400 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.8□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 C17orf51A8MQB3 221 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ZNF264O43296 627 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TCF21O43680 179 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 SLC37A1P57057 533 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 FZD5Q13467 585 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 GPX8Q8TED1 209 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TIMP4Q99727 224 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CHRNA9Q9UGM1 479 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 HSPB6O14558 160 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 ADIRFQ15847 76 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 DRAM2Q6UX65 266 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 PGAM5Q96HS1 289 aa9.79□□□□□ -0.84
ACTC1-201ENST00000290378 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms