RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 LIN54Q6MZP7 749 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 LEG1Q6P5S2 330 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM200AQ86VY9 491 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 OR5M8Q8NGP6 311 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 STOML3Q8TAV4 291 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SMCO4Q9NRQ5 59 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R8Q9NYW2 309 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SPRR3Q9UBC9 169 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 GGT3PA6NGU5 568 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 H7C1C5 153 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 GPRIN2O60269 458 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 LY86O95711 162 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A4P12235 298 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 LCN6P62502 163 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SRYQ05066 204 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF124Q15973 351 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM225Q6GV28 225 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 WDFY1Q8IWB7 410 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 OR10R2Q8NGX6 335 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 CLCC1Q96S66 551 aa17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 WISP2O76076 250 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 CD1AP06126 327 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 AKR1C3P42330 323 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ETV3LQ6ZN32 361 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TCF7L1Q9HCS4 588 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 MED29Q9NX70 200 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 KLHL13Q9P2N7 655 aa17.85■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 DNPH1O43598 174 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 FAM87AP0C7U9 286 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 DNM1P46Q6ZS02 220 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35D2Q76EJ3 337 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 UEVLDQ8IX04 471 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ASB10Q8WXI3 467 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 OXGR1Q96P68 337 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NRIP2Q9BQI9 281 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 RSRP1Q9BUV0 290 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 LUZP4Q9P127 313 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZZEF1O43149 2961 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB13A6NJU9 1138 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPB4C9JG80 1138 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPA5E9PKD4 350 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 IGHG3P01860 377 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 CD79AP11912 226 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NQO2P16083 231 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 BTF3P20290 206 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SOX2P48431 317 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 C3AR1Q16581 482 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF561Q8N587 486 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 OR1J2Q8NGS2 313 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 PHYHIPQ92561 330 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H2BAQ96A08 127 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 SLITRK2Q9H156 845 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 MMP26Q9NRE1 261 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NPIPA1Q9UND3 350 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ALPK2Q86TB3 2170 aa17.84■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 XRCC3O43542 346 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 CD34P28906 385 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 DAP3P51398 398 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 F2RL1P55085 397 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 DEFA6Q01524 100 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 C15orf54Q8N8G6 183 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF511Q8NB15 262 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 OR5AP2Q8NGF4 316 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 C1orf198Q9H425 327 aa17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
UBE2B-201ENST00000265339 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 LIPNQ5VXI9 398 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 STEAP1BQ6NZ63 245 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 STAC2Q6ZMT1 411 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 RNF141Q8WVD5 230 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TMED6Q8WW62 240 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 DMRT1Q9Y5R6 373 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ETV7Q9Y603 341 aa17.83■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 H3BSH0 61 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 XKRYO14609 159 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 OR8G3PP0DMU2 310 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TSSK2Q96PF2 358 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 MRI1Q9BV20 369 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 HRH4Q9H3N8 390 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 UPB1Q9UBR1 384 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GTI1 187 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF43P17038 809 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ADRA2CP18825 462 aa17.82■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 CPT2P23786 658 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms