RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALT7Q9UBV7 327 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TINAGQ9UJW2 476 aa23.09■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 MPDZO75970 2070 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SHISA8B8ZZ34 492 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA2E9PIF3 369 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPA3F8WFD2 350 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF16O43320 207 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 HPNP05981 417 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R31P59538 309 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 CYCSP99999 105 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf67Q0P5P2 114 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4K17Q8NGC6 315 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR13Q9H1Z4 485 aa23.08■■□□□ 1.29
CAPNS1-201ENST00000246533 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf170A2RU37 121 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C2Y5 167 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GPANK1O95872 356 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PLATP00750 562 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GP1BBP13224 206 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF117Q03924 483 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM74A1Q5RGS3 127 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DNM1P34Q6PK57 102 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PGAP1Q75T13 922 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD6Q86Y78 171 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ACKR4Q9NPB9 350 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 VSIG4Q9Y279 399 aa23.08■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SULT2B1O00204 365 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF260Q3ZCT1 412 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QL3Q5VWW1 255 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF813Q6ZN06 617 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM46BQ96A09 425 aa23.07■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM218A2RU14 115 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 F8VVB4 439 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 F8VWA3 439 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BSH0 61 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HCRTR2O43614 444 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 IL13RA1P78552 427 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C3AR1Q16581 482 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 JAGN1Q8N5M9 183 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHAF3Q9NRP4 125 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 VDAC3Q9Y277 283 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 A6NIZ1 184 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AT4A6NND4 320 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf98E9PRG8 122 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 F5H0A9 414 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FCER2P06734 321 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP1BP61224 184 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP1AP62834 184 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CDNFQ49AH0 187 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6S1Q8NH40 331 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR14L1PQ8NHC6 308 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PTDSS2Q9BVG9 487 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLN5Q9UBX5 448 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF835Q9Y2P0 537 aa23.06■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MVM7 634 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB7O75200 414 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 BPNT1O95861 308 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TPT1P13693 172 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD11B1P28845 292 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CX3CR1P49238 355 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1B3P54709 279 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCC2Q9BRT2 126 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52A1Q9UKL2 312 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHB10Q9UN67 800 aa23.05■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM74A7A6NL05 159 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2T1O43869 369 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SRD5A2P31213 254 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PCK2Q16822 640 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM74A3Q4VXF1 159 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf91Q5T1B1 145 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf33Q6P1S2 294 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF75AQ96N20 296 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NMES1Q9C002 83 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM100Q9NV29 134 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CTLA4P16410 223 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 ABOP16442 354 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 B3GALT5-AS1P59052 145 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R1AQ13522 171 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 CD163Q86VB7 1156 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 FJX1Q86VR8 437 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DOLPP1Q86YN1 238 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A7Q8NEW0 376 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 G6PC2Q9NQR9 355 aa23.04■■□□□ 1.28
CAPNS1-201ENST00000246533 DKKL1Q9UK85 242 aa23.04■■□□□ 1.28
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