RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 CEACAM3P40198 252 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 MAGEB1P43366 347 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 HNF4GQ14541 408 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CXorf58Q96LI9 332 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PCSK6P29122 969 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR1C1Q15619 314 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ZNF750Q32MQ0 723 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR6C68A6NDL8 312 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 CTAG2O75638 210 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR2AK2Q8NG84 335 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 UBE2FQ969M7 185 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 C2orf50Q96LR7 162 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SLC6A13Q9NSD5 602 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 GPR31O00270 319 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 DMBX1Q8NFW5 382 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 NPTNQ9Y639 398 aa5.65□□□□□ -1.5
SETX-201ENST00000224140 SPDEFO95238 335 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FOLR1P15328 257 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 AADACL3Q5VUY0 350 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 COMMD7Q86VX2 200 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FOXQ1Q9C009 403 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SLC25A18Q9H1K4 315 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 DOCK10Q96BY6 2186 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TNFSF11O14788 317 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR4D6Q8NGJ1 314 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CRLF2Q9HC73 371 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C5orf49A4QMS7 147 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ZNF724A8MTY0 619 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GABRB1P18505 474 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 PLGLAQ15195 96 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SSX9Q7RTT3 188 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ZNF721Q8TF20 911 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CCL11P51671 97 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ZXDAP98168 799 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR10G3Q8NGC4 313 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR10D3Q8NH80 312 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.65□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MT-CO3P00414 261 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 LIFP15018 202 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GLRA1P23415 457 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HCCSP53701 268 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 COX19Q49B96 90 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GUSBP11Q6P575 273 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR52I2Q8NH67 350 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TMEM56Q96MV1 263 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RFPL4AA6NLU0 287 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 PTP4A3O75365 173 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MT-ND4LP03901 98 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RRASP10301 218 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 COL9A1P20849 921 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 OR51S1Q8NGJ8 323 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SSUH2Q9Y2M2 353 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SMIM30A4D0T7 59 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 ANKRD34BA5PLL1 514 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CIDEAO60543 219 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 COX5AP20674 150 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 BPIFB3P59826 476 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 CLLU1Q5K131 121 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 FRZBQ92765 325 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa5.64□□□□□ -1.51
SETX-201ENST00000224140 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms