RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 CNR1P21554 472 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 OR3A2P47893 321 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 RAC3P60763 192 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 TFAP2EQ6VUC0 442 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 Q7L0L9 218 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 OR52H1Q8NGJ2 320 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 STOML3Q8TAV4 291 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 NPRL2Q8WTW4 380 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 PLEK2Q9NYT0 353 aa15.17■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 EML6Q6ZMW3 1958 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 F8VVB4 439 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 F8VWA3 439 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 HPNP05981 417 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 DBHP09172 617 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 CRYGSP22914 178 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 CPT2P23786 658 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 RTL6Q6ICC9 239 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SGK3Q96BR1 496 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.16■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SMUG1Q53HV7 270 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 OR5AP2Q8NGF4 316 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 PIK3IP1Q96FE7 263 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 LYL1P12980 280 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 RPS2P15880 293 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 SERPINA2P20848 420 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 FOLR3P41439 243 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 PPIAP62937 165 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 DRAM2Q6UX65 266 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 FAM117AQ9C073 453 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 LDAHQ9H6V9 325 aa15.15■□□□□ 0.02
CLDN11-201ENST00000064724 PATE3B3GLJ2 98 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PGAM2P15259 253 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SRD5A2P31213 254 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NAAAQ02083 359 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 BTN1A1Q13410 526 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RAB35Q15286 201 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SULF2Q8IWU5 870 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GPR137CQ8N3F9 429 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 LHFPL5Q8TAF8 219 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 S100A13Q99584 98 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 EHFQ9NZC4 300 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 H0YIZ8 118 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SYNGR3O43761 229 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PI3P19957 117 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 DCUN1D4Q92564 292 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PIGTQ969N2 578 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SPSB1Q96BD6 273 aa15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 IGHEP01854 428 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CST2P09228 141 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 Q96M66 194 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SLC39A1Q9NY26 324 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TAS2R3Q9NYW6 316 aa15.13■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MASP2O00187 686 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RRP8O43159 456 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SGCEO43556 437 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ADAP1O75689 374 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 HTR3BO95264 441 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CER1O95813 267 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GLRA1P23415 457 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ACKR3P25106 362 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 NTF4P34130 210 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 FGF16O43320 207 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 KCNAB3O43448 404 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CHAF1BQ13112 559 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 IL15RAQ13261 267 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZNF528Q3MIS6 628 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ELP2Q6IA86 826 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 GGNQ86UU5 652 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 ZBTB44Q8NCP5 570 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 PIGMQ9H3S5 423 aa15.12■□□□□ 0.01
CLDN11-201ENST00000064724 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms