RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 INTS14Q96SY0 518 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRF-216ENST00000617451 RGCCQ9H4X1 137 aa20.42■□□□□ 0.86
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PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRF3 423 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PRM7 423 aa20.41■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.41■□□□□ 0.86
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PTPRF-216ENST00000617451 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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PTPRF-216ENST00000617451 OR2T29Q8NH02 315 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTPRF-216ENST00000617451 RNF170Q96K19 258 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 REEP1Q9H902 201 aa20.36■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PQ09 198 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFB7P17568 137 aa20.35■□□□□ 0.85
PTPRF-216ENST00000617451 GABRA5P31644 462 aa20.35■□□□□ 0.85
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