RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 SIGLEC5O15389 551 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 COX7A1P24310 79 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CX3CR1P49238 355 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CAV3P56539 151 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 MXRA7P84157 204 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 AANATQ16613 207 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM219Q86XT9 240 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 MED30Q96HR3 178 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TENM3Q9P273 2699 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 RHCEP18577 417 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CD69Q07108 199 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DTX3Q8N9I9 347 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 SGK3Q96BR1 496 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DDOQ99489 341 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 MICU1Q9BPX6 476 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 SAR1AQ9NR31 198 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF878C9JN71 531 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 NME4O00746 187 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 PF4V1P10720 104 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 RAB13P51153 203 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 KLHL12Q53G59 568 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 FAM57BQ71RH2 274 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 Q8N2B8 174 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 FUZQ9BT04 418 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 NLKQ9UBE8 527 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.17□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 OR2AT4A6NND4 320 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 GSK3AP49840 483 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CAPZA1P52907 286 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 LGALS4P56470 323 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 KRTAP10-11P60412 298 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ERVFRD-1P60508 538 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 IL5RAQ01344 420 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 KRT72Q14CN4 511 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 Q6ZS46 218 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 WFDC9Q8NEX5 89 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 OR2T4Q8NH00 348 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 DHRS1Q96LJ7 313 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 BRD7Q9NPI1 651 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 TCF19Q9Y242 345 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 V9GYQ6 96 aa14.16□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 IDH3BO43837 385 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 GLRA1P23415 457 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 HSD11B1P28845 292 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ENTPD1P49961 510 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 SPIBQ01892 262 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 PRDX4Q13162 271 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF511Q8NB15 262 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 C7orf34Q96L11 122 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 EGLN3Q9H6Z9 239 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 MRGBPQ9NV56 204 aa14.15□□□□□ -0.14
CCDC40-211ENST00000574099 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 GADD45GO95257 159 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 PF4P02776 101 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 GYPBP06028 91 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 FAHP16930 419 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 SLC35A2P78381 396 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCDC40-211ENST00000574099 LINC00471Q8N535 108 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms