RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550379.1

RNF41-208, Transcript of ring finger protein 41, human

TSL 3

Gene RNF41, Length 525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF41-208	ENST00000550379	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CDH24	Q86UP0	819 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR5AS1	Q8N127	324 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF611	Q8N823	705 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PXT1	Q8NFP0	134 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	LINC01560	Q8TB33	94 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FGGY	Q96C11	551 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IL36G	Q9NZH8	169 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		V9GY05	133 aa		6.57	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	DSCAM	O60469	2012 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GGT3P	A6NGU5	568 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IFITM5	A6NNB3	132 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		E7EQL1	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	HS3ST1	O14792	307 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	LDLRAD4	O15165	306 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CTAG2	O75638	210 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	DANCR	P0C864	163 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	UBB	P0CG47	229 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CALCB	P10092	127 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF20	P17024	532 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RAB3B	P20337	219 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CCNO	P22674	350 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	BDKRB2	P30411	391 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SDC2	P34741	201 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SERPINF1	P36955	418 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GNAL	P38405	381 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RBP2	P50120	134 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RORC	P51449	518 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	VBP1	P61758	197 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NCS1	P62166	190 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PPP3R1	P63098	170 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GNG3	P63215	75 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TLE4	Q04727	773 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	UBE2V2	Q15819	145 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MST1L	Q2TV78	715 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ELP2	Q6IA86	826 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SLC22A25	Q6T423	547 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF573	Q86YE8	665 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	SOX7	Q9BT81	388 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PKIB	Q9C010	78 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	MMP27	Q9H306	513 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	IL19	Q9UHD0	177 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AKAP6	Q13023	2319 aa		6.56	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ARID1A	O14497	2285 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379		H3BUI4	141 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	AKR7A2	O43488	359 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	BPNT1	O95861	308 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	OR4A8	P0C604	315 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	RNF224	P0DH78	156 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	PAX1	P15863	534 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RNF41-208	ENST00000550379	FAH	P16930	419 aa		6.55	□□□□□ -1.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms