RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525121.2

HMGB1P40-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene HMGB1P40, Length 540 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P40-201ENST00000525121 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMEM212A6NML5 194 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 J3QRE1 110 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LGALS8O00214 317 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MYL12BO14950 172 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 NDUFA2O43678 99 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LMX1BO60663 402 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FOXH1O75593 365 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FSTL3O95633 263 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ATP6V1G2O95670 118 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CYB5AP00167 134 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 IGHV2-70P01814 119 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 IGHV2-5P01817 119 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MSMBP08118 114 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PIPP12273 146 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 GATA3P23771 443 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ACKR3P25106 362 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PSMB10P40306 273 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 GPM6AP51674 278 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CCR9P51686 369 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 AQP4P55087 323 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR12D2P58182 307 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TAS2R43P59537 309 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ISL1P61371 349 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF154Q13106 437 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SCGB2A2Q13296 93 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MAB21L1Q13394 359 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 RIPK1Q13546 671 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZMYND11Q15326 602 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MPPED2Q15777 294 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MICBQ29980 383 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SPRNQ5BIV9 151 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 WDR38Q5JTN6 314 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CEP78Q5JTW2 689 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FDX2Q6P4F2 183 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 IZUMO2Q6UXV1 221 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 DCDC5Q6ZRR9 648 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MOB3CQ70IA8 216 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF573Q86YE8 665 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR1M1Q8NGA1 313 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR4M2Q8NGB6 313 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR5A2Q8NGI9 324 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LRRC29Q8WV35 223 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 APH1BQ8WW43 257 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PP6455Q8WZ26 134 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TFAP2CQ92754 450 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MYDGFQ969H8 173 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TMEM186Q96B77 213 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ITPKCQ96DU7 683 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 PELI1Q96FA3 418 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SOX7Q9BT81 388 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 JAM3Q9BX67 310 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 BEX2Q9BXY8 128 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 SHARPINQ9H0F6 387 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 G6PC2Q9NQR9 355 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MIOXQ9UGB7 285 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR5V1Q9UGF6 321 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 HHLA2Q9UM44 414 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 V9GYS6 101 aa4.55□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 OOEPA6NGQ2 149 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 CEACAM18A8MTB9 384 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF732B4DXR9 585 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 INAFM1C9JVW0 142 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 C3orf80F5H4A9 247 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 H3BSH0 61 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 MAGEB3O15480 346 aa4.54□□□□□ -1.68
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF205O95201 554 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms