RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	COX15	Q7KZN9	410 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SSX7	Q7RTT5	188 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM151A	Q8WW52	585 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM234	Q8WY98	164 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SGTB	Q96EQ0	304 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FCRL1	Q96LA6	429 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM14	Q96QK8	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM15	Q9C019	465 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ING2	Q9H160	280 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB23	Q9ULC3	237 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR51B2	Q9Y5P1	312 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1B0GUL6	1792 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HCFC1	P51610	2035 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CACNA1S	Q13698	1873 aa		3.01	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DOCK2	Q92608	1830 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MYH7	P12883	1935 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PLPP3	O14495	311 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	AQP9	O43315	295 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SGCE	O43556	437 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	TIMP1	P01033	207 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV3-48	P01763	117 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMG1	P04279	462 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RET	P07949	1114 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT7	P08729	469 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF883	P0CG24	379 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PGA4	P0DJD7	388 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PGA3	P0DJD8	388 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PGA5	P0DJD9	388 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5H8	P0DN80	308 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CNR1	P21554	472 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEA3	P43357	314 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PPIC	P45877	212 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	HAAO	P46952	286 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS6	P49758	472 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2B8P	P59922	312 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DSTN	P60981	165 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PITPNA	Q00169	270 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	REG3A	Q06141	175 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MADCAM1	Q13477	382 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	FZD2	Q14332	565 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PON2	Q15165	354 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR4	Q16378	134 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	GSG1	Q2KHT4	349 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	BSX	Q3C1V8	233 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RAB43	Q86YS6	212 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PNKD	Q8N490	385 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZFP90	Q8TF47	636 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		3	□□□□□ -1.93
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93

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