RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 XAF1Q6GPH4 301 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 FDX2Q6P4F2 183 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 MOGAT3Q86VF5 341 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 EGFL6Q8IUX8 553 aa11.36□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 DUSP21Q9H596 190 aa11.36□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GTI1 187 aa11.35□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.34□□□□□ -0.59
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf123Q9NWV4 160 aa11.34□□□□□ -0.59
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PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa11.33□□□□□ -0.6
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PGGT1B-204ENST00000503638 DHRS7CA6NNS2 312 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
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PGGT1B-204ENST00000503638 CD200P41217 278 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 AVPI1Q5T686 147 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 RNLSQ5VYX0 342 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 BRICD5Q6PL45 260 aa11.33□□□□□ -0.6
PGGT1B-204ENST00000503638 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.33□□□□□ -0.6
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PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.33□□□□□ -0.6
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