RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TNFSF18Q9UNG2 199 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.46□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GTH9 108 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR5H14A6NHG9 310 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SPDEFO95238 335 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SIX6O95475 246 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IL2RAP01589 272 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CELA3AP09093 270 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CTLA4P16410 223 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IL32P24001 234 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 GDF1P27539 372 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 BDKRB2P30411 391 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MEOX1P50221 254 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 LHX2P50458 406 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PLA2G7Q13093 441 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF273Q14593 569 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ODF4Q2M2E3 257 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 DEFB109BQ30KR1 87 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF766Q5HY98 468 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 UEVLDQ8IX04 471 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR2V1Q8NHB1 315 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 THAP6Q8TBB0 222 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IFT46Q9NQC8 304 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MED29Q9NX70 200 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 DKK4Q9UBT3 224 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SLC22A13Q9Y226 551 aa8.45□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MED13Q9UHV7 2174 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 A0A087WV48 116 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 RAB19A4D1S5 217 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TRAPPC6AO75865 159 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CHRM2P08172 466 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 H2BFMP0C1H6 154 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 C1QTNF9P0C862 333 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF735P0CB33 412 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PGA4P0DJD7 388 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PGA3P0DJD8 388 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MMP16P51512 607 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PRKXP51817 358 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CLDN18P56856 261 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 CARD18P57730 90 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MELKQ14680 651 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ETFDHQ16134 617 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 THEM4Q5T1C6 240 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MOB3CQ70IA8 216 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MITD1Q8WV92 249 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 UCN2Q96RP3 112 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 KALRNO60229 2985 aa8.44□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF716A6NP11 495 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 MPTX1A8MV57 137 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TOR1AO14656 332 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 TNFSF11O14788 317 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 PNPP00491 289 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 RLN2P04090 185 aa8.43□□□□□ -1.06
POLR1A-208ENST00000486964 IFNA6P05013 189 aa8.43□□□□□ -1.06
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