RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ARRDC1Q8N5I2 433 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLAMF6Q96DU3 332 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MED12Q93074 2177 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 XRCC2O43543 280 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 IFNA2P01563 188 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 THBS4P35443 961 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ASCL1P50553 236 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CEBPGP53567 150 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXK1P85037 733 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HHEXQ03014 270 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PCK2Q16822 640 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PYY3Q5JQD4 70 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZSR6 202 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 Q7L0L9 218 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 LILRB2Q8N423 598 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 YPEL4Q96NS1 127 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 GPER1Q99527 375 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RFNGQ9Y644 331 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 IFITM10A6NMD0 228 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 B4DGG1 531 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 AHSA1O95433 338 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PRH1P02810 166 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HCKP08631 526 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXB2P14652 356 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HOXA5P20719 270 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS10P46783 165 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CAMLGP49069 296 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL24Q6TFL4 600 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR13H1Q8NG92 308 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MYO9BQ13459 2157 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NPIPA5E9PKD4 350 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SCGNO76038 276 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 DIRAS3O95661 229 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1D4P47884 311 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM3AP98173 230 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ACY1Q03154 408 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RHEBQ15382 184 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ACTBL2Q562R1 376 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PDZD11Q5EBL8 140 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 COMMD1Q8N668 190 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf40Q8WZ69 217 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 CUTCQ9NTM9 273 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OSGIN2Q9Y236 505 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 A0A1W2PQF6 199 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF727A8MUV8 499 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MT-ATP6P00846 226 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC6A8P48029 635 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MMP16P51512 607 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NDUFA6P56556 154 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FOXL2P58012 376 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SP6Q3SY56 376 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OR5AS1Q8N127 324 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRX2Q99811 253 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OPA3Q9H6K4 179 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 WFDC1Q9HC57 220 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 FBLN5Q9UBX5 448 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIOO75962 3097 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf16Q68DN1 1984 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 A8MVM7 634 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MASP2O00187 686 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 JTBO76095 146 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 OPN1LWP04000 364 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RNF224P0DH78 156 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 PGCP20142 388 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RTL10Q7L3V2 364 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM156Q8N614 296 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF383Q8NA42 475 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-206ENST00000469947 RARRES2Q99969 163 aa11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms