RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 PTGER4P35408 488 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 PSMB10P40306 273 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OPRL1P41146 370 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 RORCP51449 518 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GRB2P62993 217 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 HIST1H3AP68431 136 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 PMP22Q01453 160 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SGCAQ16586 387 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MOGQ16653 247 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF404Q494X3 552 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 PHYHD1Q5SRE7 291 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM27BQ5VT28 67 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 C22orf42Q6IC83 251 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MTFR2Q6P444 385 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SPSB3Q6PJ21 355 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 LRRN1Q6UXK5 716 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM91Q6ZNR0 172 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 DCXRQ7Z4W1 244 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CROCCP3Q8IVE0 287 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GJC3Q8NFK1 279 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MCFD2Q8NI22 146 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 FNDC9Q8TBE3 224 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 S100ZQ8WXG8 99 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 AP3S1Q92572 193 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SLAMF6Q96DU3 332 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TAAR6Q96RI8 345 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 AMELYQ99218 206 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TTTY10Q9BZA0 68 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MOB1AQ9H8S9 216 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM38BQ9NVV0 291 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 R4GMQ9 66 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GTF3C1Q12789 2109 aa4.96□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ACACAQ13085 2346 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF879B4DU55 563 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TAF4O00268 1085 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CASKO14936 926 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 KRT33AO76009 404 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CDRT1O95170 752 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 FARS2O95363 451 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ISG15P05161 165 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 UCHL1P09936 223 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 PSKH1P11801 424 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GABRA1P14867 456 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MYL9P24844 172 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CDAP32320 146 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 S100A5P33763 92 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 PCBD1P61457 104 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ECH1Q13011 328 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TAF13Q15543 124 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 Q499Y3 187 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM244Q5VVB8 128 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OR2A2Q6IF42 318 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OR7E24Q6IFN5 339 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CEACAM19Q7Z692 300 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 DPPA2Q7Z7J5 298 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 CATSPERDQ86XM0 798 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 MED12LQ86YW9 2145 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 TUSC5Q8IXB3 177 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF100Q8IYN0 542 aa4.95□□□□□ -1.62
NANOGP9-201ENST00000439890 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms