RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSD11B1P28845 292 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 FMO3P31513 532 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC15A1P46059 708 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 GSK3AP49840 483 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 TSPAN31Q12999 210 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DGUOKQ16854 277 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDXQ7Z353 690 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF511Q8NB15 262 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDOQ99489 341 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.91□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHRS12A0PJE2 317 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 AKR7A2O43488 359 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 GYPBP06028 91 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 PAX6P26367 422 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 PSME3P61289 254 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL5RAQ01344 420 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 HCP5Q6MZN7 132 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM57BQ71RH2 274 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR5D13Q8NGL4 314 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 RTL8AQ9BWD3 113 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 SP140LQ9H930 580 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCD2Q9UBJ2 740 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.9□□□□□ -0.02
UPK3BP1-201ENST00000428678 SIGLEC5O15389 551 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 FBXO24O75426 580 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 RRM2P31350 389 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 GABRA2P47869 451 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAV3P56539 151 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 KLHL12Q53G59 568 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 FTMTQ8N4E7 242 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANGPTL6Q8NI99 470 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 PYURFQ96I23 114 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 AJUBAQ96IF1 538 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 MMP28Q9H239 520 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 BRD7Q9NPI1 651 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD300AQ9UGN4 299 aa14.89□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHST1O43916 411 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 SEMG1P04279 462 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 BMXP51813 675 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 MXRA7P84157 204 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 SNCBQ16143 134 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 AANATQ16613 207 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 TEX30Q5JUR7 227 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB37Q5TC79 503 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 RNF148Q8N7C7 305 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 DTX3Q8N9I9 347 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHF21AQ96BD5 680 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 R3HDM4Q96D70 268 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR10A2Q9H208 303 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 NLKQ9UBE8 527 aa14.88□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM210A6NLX4 147 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR2AT4A6NND4 320 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF850A8MQ14 1090 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 APOC1P02654 83 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CD28P10747 220 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPI1P17947 270 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRDX4Q13162 271 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRMP1Q14194 572 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 PGAM5Q96HS1 289 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 OR4F4Q96R69 305 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 MPC1Q9Y5U8 109 aa14.87□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC22O60826 627 aa14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 FABP3P05413 133 aa14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLUP10909 449 aa14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.86□□□□□ -0.03
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms