RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 SLC17A2O00624 439 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 YIF1AO95070 293 aa13.04□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 PCMT1P22061 227 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 SLC37A1P57057 533 aa13.04□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.04□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 PRRX2Q99811 253 aa13.04□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 CA13Q8N1Q1 262 aa13.03□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CDAP32320 146 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R45P59539 299 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ERVFC1-1P60608 527 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 PPP1CBP62140 327 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.03□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 HAAOP46952 286 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CCL11P51671 97 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 C17orf78Q8N4C9 275 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC74BQ96LY2 380 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 GPANK1O95872 356 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 IGHEP01854 428 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 ST6GAL1P15907 406 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 DEFB108BQ8NET1 73 aa13.03□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 C8orf44Q96CB5 159 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 POM121Q96HA1 1249 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 OR8B4Q96RC9 309 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 METTL12A8MUP2 240 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CDK5Q00535 292 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 IQCJQ1A5X6 159 aa13.02□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 PRR35P0CG20 571 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CSN1S1P47710 185 aa13.02□□□□□ -0.32
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PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 OR4D10Q8NGI6 311 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
PTPRU-204ENST00000428026 XKRY2A2RUG3 117 aa13.02□□□□□ -0.33
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PTPRU-204ENST00000428026 GLRA1P23415 457 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 DPTQ07507 201 aa13.02□□□□□ -0.33
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PTPRU-204ENST00000428026 SMUG1Q53HV7 270 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 CBLN2Q8IUK8 224 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 FBXL6Q8N531 539 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF835Q9Y2P0 537 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 SH2D1BO14796 132 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 CST4P01036 141 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 CD96P40200 585 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 PMS2P11Q13670 270 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 UBALD1Q8TB05 177 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 MSL2Q9HCI7 577 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 RAB18Q9NP72 206 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GTH9 108 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H3AP68431 136 aa13.02□□□□□ -0.33
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