RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 OR56B2PQ8NGI1 322 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM4Q8WVI0 70 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CMBLQ96DG6 245 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 WBP1Q96G27 269 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC120Q96HB5 630 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RNF170Q96K19 258 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BANF2Q9H503 90 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF391Q9UJN7 358 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RAB22AQ9UL26 194 aa13.25□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ESPL1Q14674 2120 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0G2JNJ9 132 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM14DPA8MWL7 114 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LYRM1O43325 122 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FAM157BP0CG42 384 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CBR1P16152 277 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BMP5P22003 454 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PTGFRP43088 359 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MTCP1P56278 107 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GUCA2AQ02747 115 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MALLQ13021 153 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GPR176Q14439 515 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CDH26Q8IXH8 852 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ACBD4Q8NC06 268 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 Q9UFV3 132 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GPR160Q9UJ42 338 aa13.24□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MEIS3P1A6NDR6 274 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LILRA1O75019 489 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GDNFP39905 211 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ERVS71-1P61550 626 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 P2RY6Q15077 328 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ALKBH2Q6NS38 261 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BHLHE23Q8NDY6 225 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 UBASH3BQ8TF42 649 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FAM122AQ96E09 287 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BOD1Q96IK1 185 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 NICN1Q9BSH3 213 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0A6YYD4 124 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FUOMA2VDF0 154 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 GABARAPH6UMI1 98 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PLATP00750 562 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FCER2P06734 321 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 VEGFCP49767 419 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 IGFBP7Q16270 282 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FCAMRQ8WWV6 532 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PTX4Q96A99 478 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PHF21AQ96BD5 680 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A4Q9H015 551 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TBCCD1Q9NVR7 557 aa13.23□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ANGPTL7O43827 346 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MPIG6BO95866 241 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV3-15P01624 115 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 NAT2P11245 290 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RAB6AP20340 208 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 HOXC12P31275 282 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 MNDAP41218 407 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FAM27E3Q08E93 113 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CARTPTQ16568 116 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PLCXD3Q63HM9 321 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 OR2T2Q6IF00 324 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LIX1LQ8IVB5 337 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TOMM5Q8N4H5 51 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SFXN3Q9BWM7 321 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PRORYQ9H606 182 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CDH20Q9HBT6 801 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KCNN3Q9UGI6 736 aa13.22□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RAB27BO00194 218 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CDC14BO60729 498 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ZP1P60852 638 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 KLRB1Q12918 225 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LY6DQ14210 128 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM255AQ5JRV8 349 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 CADM3Q8N126 398 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 S100PBPQ96BU1 408 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 BORCS8Q96FH0 119 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 LPAR5Q9H1C0 372 aa13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
CASQ1-201ENST00000368078 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms