RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347055.3

KRCC1-201, Transcript of lysine rich coiled-coil 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KRCC1, Length 1,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1-201ENST00000347055 PTGER4P35408 488 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 P2RY1P47900 373 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 DNLZQ5SXM8 178 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR10S1Q8NGN2 331 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 DDIT4LQ96D03 193 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR11A1Q9GZK7 315 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SLC35B3Q9H1N7 401 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 LHX6Q9UPM6 363 aa16.06■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TLCD2A6NGC4 264 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GPR137BO60478 399 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GLRA1P23415 457 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR3A4PP47883 348 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TLE3Q04726 772 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SPEM2Q0P670 501 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 KCNMB1Q16558 191 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 MIDNQ504T8 468 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GKN2Q86XP6 184 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 LRRC18Q8N456 261 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR1N1Q8NGS0 311 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 S100A13Q99584 98 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FOXQ1Q9C009 403 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 A6NLC8 198 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 AGPAT2O15120 278 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CLN5O75503 358 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 HCKP08631 526 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SULT1A1P50225 295 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR2A2Q6IF42 318 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SLC16A14Q7RTX9 510 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SULF2Q8IWU5 870 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 LRTM2Q8N967 370 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OPA3Q9H6K4 179 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SPACA1Q9HBV2 294 aa16.05■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PPH5 198 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SEMA4FO95754 770 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GIMD1P0DJR0 217 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 RAB2AP61019 212 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SLC35A1P78382 337 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FZD2Q14332 565 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 WDSUB1Q8N9V3 476 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 RAB33BQ9H082 229 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 KCNJ16Q9NPI9 418 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 C19orf12Q9NSK7 152 aa16.04■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 UMAD1C9J7I0 102 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 M0R036 132 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ADAM10O14672 748 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GMFGO60234 142 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PI3P19957 117 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CHATP28329 748 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GRB2P62993 217 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 IL13RA2Q14627 380 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CLINT1Q14677 625 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 KRBOX4Q5JUW0 171 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PARM1Q6UWI2 310 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SPRED2Q7Z698 418 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TSLPQ969D9 159 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PECRQ9BY49 303 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 A0A1W2PPE3 182 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 BTBD17A6NE02 478 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 PPIHO43447 177 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CBR1P16152 277 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CTSSP25774 331 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CAMLGP49069 296 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CD81P60033 236 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 C17orf67Q0P5P2 114 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 FAM219AQ8IW50 185 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 CARFQ8N187 725 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 C10orf35Q96D05 121 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GALNT14Q96FL9 552 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 YPEL4Q96NS1 127 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 GPER1Q99527 375 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 TCFL5Q9UL49 500 aa16.03■□□□□ 0.16
KRCC1-201ENST00000347055 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms