RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 RBP2P50120 134 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 LHX2P50458 406 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 PLA1AQ53H76 456 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 VHLLQ6RSH7 139 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 OR10R2Q8NGX6 335 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CCDC107Q8WV48 283 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 METTL9Q9H1A3 318 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 A0A1B0GTI1 187 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 E9PLN8 166 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 NME2P1O60361 137 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 NME2P22392 152 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ATP1B3P54709 279 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 FTMTQ8N4E7 242 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 OR51F2Q8NH61 342 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 LOC400499M0QZD8 3231 aa11.35□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 PRR33A8MZF0 331 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 LINC01387J3KSC0 135 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CYTIPO60759 359 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ISG15P05161 165 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 POFUT1Q9H488 388 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 EHFQ9NZC4 300 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CCSO14618 274 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ZNF92Q03936 586 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 UBE2V2Q15819 145 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 C1QL2Q7Z5L3 287 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 PRR18Q8N4B5 295 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 DEDD2Q8WXF8 326 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 SEH1LQ96EE3 360 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CACNA1DQ01668 2161 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 IGF2RP11717 2491 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 DNPH1O43598 174 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 BPNT1O95861 308 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CAPZA1P52907 286 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CLDN18P56856 261 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RTN4RL2Q86UN3 420 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 FZR1Q9UM11 496 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.34□□□□□ -0.59
HPS1-201ENST00000325103 CST2P09228 141 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 GPM6AP51674 278 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 GFRA1P56159 465 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 BTG1P62324 171 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 C10orf128Q5T292 105 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 CDC14BO60729 498 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 HAAOP46952 286 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 TNFSF10P50591 281 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 OR2T2Q6IF00 324 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 OR14K1Q8NGZ2 314 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 CHST6Q9GZX3 395 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SH2D2AQ9NP31 389 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 KCNN3Q9UGI6 736 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ERP29P30040 261 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 TCF15Q12870 199 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 GSG1Q2KHT4 349 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 C6orf183Q5T699 404 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 RNF138Q8WVD3 245 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ZNF318Q5VUA4 2279 aa11.33□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 SPTBN4Q9H254 2564 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 ARPC5O15511 151 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 AGFG2O95081 481 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 NGFP01138 241 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 CPT2P23786 658 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 THBS4P35443 961 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 GSK3AP49840 483 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 OR8H3Q8N146 312 aa11.32□□□□□ -0.6
HPS1-201ENST00000325103 FBXL14Q8N1E6 418 aa11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms