RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PRKACAP17612 351 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CDAP32320 146 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR3A4PP47883 348 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 F2RL1P55085 397 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PPIAP62937 165 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SKA3Q8IX90 412 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR2M3Q8NG83 312 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ALPK3Q96L96 1907 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR6C6A6NF89 314 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CA11O75493 328 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 HLA-DOBP13765 273 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 CCL7P80098 99 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF266Q14584 549 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 M1APQ8TC57 530 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 TMED6Q8WW62 240 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A28Q96A46 364 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PECRQ9BY49 303 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 GPR173Q9NS66 373 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 DENND4AQ7Z401 1863 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 TOR1AO14656 332 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ATG12O94817 140 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 IFNA1P01562 189 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 IFNA17P01571 189 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 NME2P22392 152 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PLAURQ03405 335 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 REEP6Q96HR9 211 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 RAB27BO00194 218 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 DNPH1O43598 174 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 GPR137BO60478 399 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB7O75200 414 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OTX2P32243 289 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 FUT6P51993 359 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MKXQ8IYA7 352 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 OR1S1Q8NH92 325 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 ST7LQ8TDW4 575 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 PIGCQ92535 297 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 HLA-CQ95604 372 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.84□□□□□ -1.15
HERC3-201ENST00000264345 A8MXK9 166 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LINC01387J3KSC0 135 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 LAMTOR5O43504 91 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 FCGR2CP31995 323 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SPACA5Q96QH8 159 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 WDR54Q9H977 334 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 A0A0U1RQV5 110 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RER1O15258 196 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ST8SIA3O43173 380 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 PGA4P0DJD7 388 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 PGA3P0DJD8 388 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 OR5H8P0DN80 308 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 GDF1P27539 372 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 OR9K2Q8NGE7 335 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 IFI44Q8TCB0 444 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 ZNF17P17021 662 aa7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
HERC3-201ENST00000264345 MICBQ29980 383 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms