RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9930022D16RikQ8BG27 128 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lair1Q8BG84 263 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8BH50 245 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmf1Q8BHL8 271 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnfsfm13Q8BXS2 410 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r6Q8R2D4 303 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r8Q8R3G1 351 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr307Q8VFN8 313 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr360Q8VFP3 317 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr825Q8VFU7 320 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr770Q8VGC2 311 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dnajc9Q91WN1 259 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pole4Q9CQ36 118 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pnrc2Q9CR73 140 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps30Q9D0G0 442 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fank1Q9DAM9 344 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prkar1aQ9DBC7 381 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r41Q9EQ44 310 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sema7aQ9QUR8 664 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Skp2Q9Z0Z3 424 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hivep3A2A884 2348 aa9.47□□□□□ -0.89
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r82A0A087WRV1 305 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13124A2A752 406 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13769A2ATW2 309 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrap2D3Z1Q2 207 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr466E9Q2B9 308 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10073E9Q3T0 114 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm20939L7N243 523 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpnO35453 436 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hdac3O88895 424 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10881P01642 115 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpm6aP35802 278 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h3aP68433 136 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hist1h3bP84228 136 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tigd2Q0VBL1 525 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 XylbQ3TNA1 551 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DbpQ60925 325 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adam30Q811Q3 732 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cggbp1Q8BHG9 167 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp747Q8BHM7 422 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FkrpQ8CG64 494 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nsun5Q8K4F6 465 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr279Q8VFD8 310 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr854Q8VFF1 315 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ier3ip1Q9CR20 82 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chaf1bQ9D0N7 572 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppil3Q9D6L8 161 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slamf9Q9D780 285 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arfgap3Q9D8S3 523 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TrmuQ9DAT5 417 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arfgap1Q9EPJ9 414 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube4bQ9ES00 1173 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc13a2Q9ES88 586 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kat2aQ9JHD2 830 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dolpp1Q9JMF7 238 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex14Q9R0A0 376 aa9.46□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ighv5-4A0A075B5P9 117 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trav12-2A0N8N6 114 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1018A2ASV3 311 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r137D3YTY1 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 9830107B12RikD3Z5D6 160 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r143E9PUW9 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700003H04RikE9PXM2 192 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc28a1E9PXX9 648 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r157E9Q069 297 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr424E9Q0Q2 315 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr554E9Q546 317 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r139E9Q8L6 297 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prss56F2YMG0 604 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc38a6G3UVW3 457 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r112G3UY48 297 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r135K9J7G0 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r125L7N227 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r116L7N2A6 307 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc22a1O08966 556 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NapsaO09043 419 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx3O70492 162 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc153P0C7Q1 202 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 H2-D1P14427 368 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SellP18337 372 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tdgf1P51865 171 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rce1P57791 329 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl21Q3U410 597 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lingo2Q3URE9 606 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bbs1Q3V3N7 593 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PnkdQ69ZP3 385 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35f2Q7TML3 375 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1229Q7TQZ9 311 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr17Q7TRM9 315 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox21Q811W0 276 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reep1Q8BGH4 201 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc35f1Q8BGK5 408 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm26558Q8BLW8 286 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hs3st5Q8BSL4 346 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exosc6Q8BTW3 273 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bmt2Q8BXK4 403 aa9.45□□□□□ -0.9
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubqln3Q8C5U9 658 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.9 ms