RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM56	Q96MV1	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ING2	Q9H160	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	A2M	P01023	1474 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	NBR2	O15453	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCL2L11	O43521	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CXCL13	O43927	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CEL	P19835	753 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPR2	P20594	1047 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	GCA	P28676	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CRYBB2	P43320	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SNAP25	P60880	206 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	LCN2	P80188	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	EMX2	Q04743	252 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MPPED2	Q15777	294 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRR4	Q16378	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAPK14	Q16539	360 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SKA3	Q8IX90	412 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAF2	Q96CS3	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	HBEGF	Q99075	208 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MRO	Q9BYG7	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	RAB34	Q9BZG1	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1W2PRD5	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	PRKAB2	O43741	272 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	HSBP1	O75506	76 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADAP1	O75689	374 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	RP2	O75695	350 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	LALBA	P00709	142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CST1	P01037	141 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	BCKDHB	P21953	392 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAS	P25445	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACLY	P53396	1101 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	GNGT1	P63211	74 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	BNIP2	Q12982	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	APOF	Q13790	326 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-222	ENST00000575909	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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