RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUXAA6NLW8 204 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C12orf71A8MTZ7 269 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMTNL1A8MU46 457 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPTX1A8MV57 137 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MCIDASD6RGH6 385 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC1A7O00341 560 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIGLEC5O15389 551 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TYROBPO43914 113 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 AIREO43918 545 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMDSO60547 372 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ICMTO60725 284 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBX19O60806 448 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTP4A3O75365 173 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCN3O75636 299 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 UGT2B17O75795 530 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 AK1P00568 194 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFI6P09912 130 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIPP12273 146 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NR2C1P13056 603 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GFAPP14136 432 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 COMTP21964 271 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CA6P23280 308 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRPRP30550 384 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADMP35318 185 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOX6P35712 828 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGM1P36871 562 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP2K4P45985 399 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR4P46093 362 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RWDD2BP57060 319 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYNJ2BPP57105 145 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP6V0D1P61421 351 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSG4Q00888 419 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PUDPQ08623 228 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SCRN3Q0VDG4 424 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 BNIP2Q12982 314 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MPP2Q14168 576 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF460Q14592 562 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM187Q14656 261 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLINT1Q14677 625 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDK5R1Q15078 307 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF124Q15973 351 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GSTA3Q16772 222 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PFKFB4Q16877 469 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPEL1Q2QD12 228 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RFX4Q33E94 735 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC22A6Q4U2R8 563 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C4orf46Q504U0 113 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TM4SF20Q53R12 229 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPIN4Q56A73 249 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 STUMQ69YW2 141 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM200BQ69YZ2 307 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NXNQ6DKJ4 435 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMARCD3Q6STE5 483 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C5orf46Q6UWT4 87 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLEC19AQ6UXS0 136 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF826PQ6ZT77 177 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGAP1Q75T13 922 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPY19L4Q7Z388 723 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDDC2Q7Z4H3 204 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALHM1Q8IU99 346 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CREG2Q8IUH2 290 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf107Q8IVU9 208 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOMEZQ8IX15 550 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC38A6Q8IZM9 456 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GBGT1Q8N5D6 347 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 DPP10Q8N608 796 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2T27Q8NH04 317 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR56B4Q8NH76 319 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC35G2Q8TBE7 412 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 STK35Q8TDR2 534 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C16orf78Q8WTQ4 265 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYROXD1Q8WU10 500 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR5P2Q8WZ92 322 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC38A4Q969I6 547 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TOMM40LQ969M1 308 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPEQ96AT9 228 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 C10orf35Q96D05 121 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF125Q96EQ8 232 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 GAFA1Q96PS6 74 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM237Q96Q45 408 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 WFDC6Q9BQY6 131 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHRDL1Q9BU40 450 aa1.37□□□□□ -2.19
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUF2Q9BZD4 464 aa1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms