RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCN2BO60939 215 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 EEDO75530 441 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CXorf1O96002 111 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGKV1D-33P01593 117 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGKV1-33P01594 117 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGKV5-2P06315 115 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAX6P26367 422 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 LAP3P28838 519 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 XKP51811 444 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CD164Q04900 197 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDK5R1Q15078 307 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 AMN1Q8IY45 258 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 UBAC2Q8NBM4 344 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 STMN2Q93045 179 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SNX21Q969T3 373 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CLDN23Q96B33 292 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMIGD2Q96BF3 282 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 C14orf79Q96F83 325 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q96MT0 163 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ADPGKQ9BRR6 497 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBXL3Q9UKT7 428 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRP2P98164 4655 aa-1.29□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYH11P35749 1972 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CNTNAP1P78357 1384 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 A8MWP4 228 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDC7O00311 574 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 FGGP02679 453 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC192P0DO97 292 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC6A1P30531 599 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CD70P32970 193 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TUFMP49411 452 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPA4Q13156 261 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 NAB1Q13506 487 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 NNATQ16517 81 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 BCL2A1Q16548 175 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF439Q8NDP4 499 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 DCAKDQ8WVC6 231 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 NDUFB11Q9NX14 153 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR5V1Q9UGF6 321 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 VPREB3Q9UKI3 123 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-1.3□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 UNC79Q9P2D8 2635 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 A0A1B0GVG6 124 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SYCE3A1L190 88 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 J3QQQ9 107 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ERI3O43414 337 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 FMO6PO60774 539 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MT-ATP6P00846 226 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SERPIND1P05546 499 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 HTR1DP28221 377 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 HTR2AP28223 471 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SSR4P51571 173 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 NDUFA8P51970 172 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDH6P55285 790 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPL26P61254 145 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 RALBP1Q15311 655 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF726P1Q15940 193 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCL15Q16663 113 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TATDN3Q17R31 274 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 HHATQ5VTY9 493 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 UBE2UQ5VVX9 321 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PYHIN1Q6K0P9 492 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 WDR31Q8NA23 367 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MFSD9Q8NBP5 474 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIBF1Q8WXW3 757 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 DERL3Q96Q80 235 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC38A2Q96QD8 506 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TXNIPQ9H3M7 391 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 PIGUQ9H490 435 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM9BQ9NQ34 198 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM38BQ9NVV0 291 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAS2R9Q9NYW1 312 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 MED12Q93074 2177 aa-1.31□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 ALPK3Q96L96 1907 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-772P-201ENST00000516042 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms