RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481242.5

GARNL3-216, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 2

Gene GARNL3, Length 4,816 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-216ENST00000481242 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 A0A0B4J203 849 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SIRPB1O00241 398 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TAAR5O14804 337 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 WDR1O75083 606 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SLC2A10O95528 541 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FUT3P21217 361 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 NPY4RP50391 375 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HMGA2P52926 109 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FGF11Q92914 225 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FAM60AQ9NP50 221 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 M0QYG6 137 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SLC17A2O00624 439 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 BMI1P35226 326 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PCP4P48539 62 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SCAND1P57086 179 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FZD5Q13467 585 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TAF9Q16594 264 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HFEQ30201 348 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TEX261Q6UWH6 196 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 NUDT8Q8WV74 236 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HPSE2Q8WWQ2 592 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 RAB1CQ92928 201 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TAAR6Q96RI8 345 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 RASL10BQ96S79 203 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ARV1Q9H2C2 271 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 U3KQ87 197 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR5B21A6NL26 309 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 M0QZK8 103 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 BMP5P22003 454 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HCCSP53701 268 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 WNT3P56703 355 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TAS2R45P59539 299 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PET117Q6UWS5 81 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FJX1Q86VR8 437 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR51H1Q8NH63 302 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR6X1Q8NH79 312 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 GPX8Q8TED1 209 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 GALMQ96C23 342 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 A0A1B0GTL3 188 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TCAPO15273 167 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FBXO24O75426 580 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 GPX5O75715 221 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 CD3EP07766 207 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 MGMTP16455 207 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ALOX5APP20292 161 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 CSN1S1P47710 185 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 KCNJ3P48549 501 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ISXQ2M1V0 245 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PLA1AQ53H76 456 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 FRZBQ92765 325 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PELI1Q96FA3 418 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 VPS25Q9BRG1 176 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 RAB33BQ9H082 229 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR5H8P0DN80 308 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OMGP23515 440 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 S100A11P31949 105 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SCGB2A2Q13296 93 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 STPG1Q5TH74 334 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 C12orf73Q69YU5 71 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 C17orf47Q8NEP4 570 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 PTP4A1Q93096 173 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR2W5A6NFC9 320 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 STPG2Q8N412 459 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 SLC30A7Q8NEW0 376 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-216ENST00000481242 OR5D13Q8NGL4 314 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms