RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 IRF2P14316 349 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF85Q03923 595 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LPCAT4Q643R3 524 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 IL17RELQ6ZVW7 336 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 C11orf53Q8IXP5 236 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ELMOD2Q8IZ81 293 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 GALNT4Q8N4A0 578 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 KLHL36Q8N4N3 616 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 YIPF7Q8N8F6 280 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR51E1Q8TCB6 317 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ITPKCQ96DU7 683 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RDH12Q96NR8 316 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 GPR84Q9NQS5 396 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 C1orf123Q9NWV4 160 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RNF7Q9UBF6 113 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB10Q9UN67 800 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MPC1Q9Y5U8 109 aa17.57■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 TRAV20A0A0B4J274 112 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 METTL15A6NJ78 407 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF850A8MQ14 1090 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MPZL2O60487 215 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SULT1C4O75897 302 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RPP14O95059 124 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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ACTB-211ENST00000480301 GRPP07492 148 aa17.56■□□□□ 0.4
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ACTB-211ENST00000480301 GNALP38405 381 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PRDX4Q13162 271 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LRRC36Q1X8D7 754 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FTMTQ8N4E7 242 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PIGCQ92535 297 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ITFG2Q969R8 447 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 TMEM246Q9BRR3 403 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MOB1AQ9H8S9 216 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR52A1Q9UKL2 312 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SNX5Q9Y5X3 404 aa17.56■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM18A8MTB9 384 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 WNT2P09544 360 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FAM157CP0CG43 387 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PCMT1P22061 227 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MAP2K3P46734 347 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 IL5RAQ01344 420 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF404Q494X3 552 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LIPNQ5VXI9 398 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 C19orf18Q8NEA5 215 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR1M1Q8NGA1 313 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 OR5P3Q8WZ94 311 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 MICU1Q9BPX6 476 aa17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 A0A1B0GTI1 187 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SNTNA6NMZ2 147 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ATP6V1B1P15313 513 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PEX2P28328 305 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ISL1P61371 349 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF154Q13106 437 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 COMMD2Q86X83 199 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 CATSPERDQ86XM0 798 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 PACRGLQ8N7B6 248 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF555Q8NEP9 628 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 APH1BQ8WW43 257 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RORBQ92753 470 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LGALS12Q96DT0 336 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ABCB9Q9NP78 766 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A13Q9Y226 551 aa17.54■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 A6NLC8 198 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ANXA2P2A6NMY6 339 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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ACTB-211ENST00000480301 HNF1AP20823 631 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 THBS2P35442 1172 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 CSNK2BP67870 215 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ACTC1P68032 377 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ACTA1P68133 377 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 LCN2P80188 198 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 ZNF91Q05481 1191 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 TP53I3Q53FA7 332 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 GCSAMQ8N6F7 178 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 DEFB108BQ8NET1 73 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 HPSE2Q8WWQ2 592 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 Q96MT0 163 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 TLNRD1Q9H1K6 362 aa17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
ACTB-211ENST00000480301 AMBNQ9NP70 447 aa17.53■□□□□ 0.4
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