RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 COX5BP10606 129 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 FABP4P15090 132 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ZNF708P17019 499 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ANOS1P23352 680 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SNCAP37840 140 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RGS19P49795 217 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RAB5CP51148 216 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ZNF77Q15935 545 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ZNF674Q2M3X9 581 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 KHDC3LQ587J8 217 aa7.07□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HOGA1Q86XE5 327 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.07□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 POC1BQ8TC44 478 aa7.07□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 EPOPA6NHQ4 379 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CYR61O00622 381 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SLC31A2O15432 143 aa7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CX3CR1P49238 355 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 A0A0A6YYD4 124 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 XRCC2O43543 280 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RAD51DO75771 328 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 DRD3P35462 400 aa7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 GLRX2Q9NS18 164 aa7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.06□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BBP33778 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 THBS4P35443 961 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BDP58876 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BCP62807 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CCL20P78556 96 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PCK2Q16822 640 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.06□□□□□ -1.28
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