RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	MPPED2	Q15777	294 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ODF4	Q2M2E3	257 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LIPN	Q5VXI9	398 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	RAB39B	Q96DA2	213 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	LGALS12	Q96DT0	336 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		14.96	□□□□□ -0.01
USP19-210	ENST00000465902	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	TTR	P02766	147 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ACKR3	P25106	362 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	LMO4	P61968	165 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRDX4	Q13162	271 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF691	Q5VV52	312 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SETD9	Q8NE22	299 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ERGIC1	Q969X5	290 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MICU1	Q9BPX6	476 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		14.95	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		B4DSR2	109 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	FAM157A	C9JC47	383 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	P2RY10	O00398	339 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	LMX1B	O60663	402 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	FAM20B	O75063	409 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	IGHV2-70	P01814	119 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PSMB10	P40306	273 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PMEL	P40967	661 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	GATA4	P43694	442 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND11	Q15326	602 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	APH1B	Q8WW43	257 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RORB	Q92753	470 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ADI1	Q9BV57	179 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		14.94	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		H3BSH0	61 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		J3QLW9	94 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		J3QRE1	110 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CST4	P01036	141 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF19	P17023	458 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CAPG	P40121	348 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	KLHL22	Q53GT1	634 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	FAM201A	Q5SY85	155 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	SPIC	Q8N5J4	248 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RNF7	Q9UBF6	113 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		14.93	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902		A0A1B0GVI7	797 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4D	F5H284	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	DHRS3	O75911	302 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	IGHV2-5	P01817	119 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MSMB	P08118	114 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1B1	P15313	513 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	FAH	P16930	419 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	OR12D2	P58182	307 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ACTA2	P62736	377 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ACTG2	P63267	376 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	RAB40B	Q12829	278 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	CDON	Q4KMG0	1287 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	MOB3C	Q70IA8	216 aa		14.92	□□□□□ -0.02
USP19-210	ENST00000465902	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		14.92	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms