RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GPR50Q13585 617 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ADIPOQQ15848 244 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GABRA6Q16445 453 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CTF1Q16619 201 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SPATC1Q76KD6 591 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 KRT77Q7Z794 578 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 LRRC18Q8N456 261 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TEX29Q8N6K0 151 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 YIPF7Q8N8F6 280 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 IL17RDQ8NFM7 739 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR51F2Q8NH61 342 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 MRAPQ8TCY5 172 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 MROQ9BYG7 248 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PLK3Q9H4B4 646 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FAM206AQ9NX38 181 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 R4GMQ9 66 aa8.56□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 A0A096LPE4 126 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PPZ6 126 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SYNGR3O43761 229 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DOK2O60496 412 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GPX5O75715 221 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SC5DO75845 299 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 H2BFMP0C1H6 154 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CELP19835 753 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ANOS1P23352 680 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PPOXP50336 477 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 WDR38Q5JTN6 314 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 BRICD5Q6PL45 260 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ARL9Q6T311 187 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GJC3Q8NFK1 279 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RAB2BQ8WUD1 216 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 COQ7Q99807 217 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ATF6BQ99941 703 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR51E2Q9H255 320 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 MOB1AQ9H8S9 216 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TREM2Q9NZC2 230 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 STUB1Q9UNE7 303 aa8.55□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 B9A039 149 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 G3V4G9 280 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 SGCEO43556 437 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ZFPL1O95159 310 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 UBL3O95164 117 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 HLA-HP01893 362 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 OR4A8P0C604 315 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PATE4P0C8F1 98 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 NR4A1P22736 598 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 FPR2P25090 351 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CRYBB2P43320 205 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 MMP16P51512 607 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 CCR9P51686 369 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PCBD1P61457 104 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 GRB2P62993 217 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 PSG4Q00888 419 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 HGFACQ04756 655 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 EFNB3Q15768 340 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
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