RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370287.7

CSAG1-202, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAG1, Length 875 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-202ENST00000370287 HPSE2Q8WWQ2 592 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RFKQ969G6 155 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ITPKCQ96DU7 683 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RNFT2Q96EX2 444 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 TMEM246Q9BRR3 403 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 GPR84Q9NQS5 396 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 C1orf123Q9NWV4 160 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF391Q9UJN7 358 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PCDHB10Q9UN67 800 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.51□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 A6NLC8 198 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PPIAL4DF5H284 164 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RPP14O95059 124 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 IRF2P14316 349 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ANPEPP15144 967 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 EGR1P18146 543 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SRD5A1P18405 259 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 HNF1AP20823 631 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 THBS2P35442 1172 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 GNALP38405 381 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF154Q13106 437 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF404Q494X3 552 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LPCAT4Q643R3 524 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 COMMD2Q86X83 199 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 GALNT4Q8N4A0 578 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 YIPF7Q8N8F6 280 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PLPP7Q8NBV4 271 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PIGCQ92535 297 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 C14orf119Q9NWQ9 140 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RNF7Q9UBF6 113 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 OR52A1Q9UKL2 312 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PPIAL4AQ9Y536 164 aa12.5□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 METTL15A6NJ78 407 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 C3orf80F5H4A9 247 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 J3QRE1 110 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 CST4P01036 141 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 AVPP01185 164 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 KRT8P05787 483 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RPS2P15880 293 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PEX2P28328 305 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ATP6V1E1P36543 226 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MTNR1AP48039 350 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF91Q05481 1191 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 DMRTC1Q5HYR2 192 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 BCL2L15Q5TBC7 163 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LIPNQ5VXI9 398 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LYPD2Q6UXB3 125 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ELMOD2Q8IZ81 293 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 GCSAMQ8N6F7 178 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 DEFB108BQ8NET1 73 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 APH1BQ8WW43 257 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FAHD2AQ96GK7 314 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MOB1AQ9H8S9 216 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MPC1Q9Y5U8 109 aa12.49□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 A0A1B0GTI1 187 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ANXA2P2A6NMY6 339 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 A8MXK9 166 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 P2RY10O00398 339 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SLC16A6O15403 523 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FSTL3O95633 263 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 WNT2P09544 360 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 FAHP16930 419 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PCMT1P22061 227 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 PSMB10P40306 273 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MAP2K3P46734 347 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ISL1P61371 349 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 IL5RAQ01344 420 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 MZT1Q08AG7 82 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SNCBQ16143 134 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 TP53I3Q53FA7 332 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 CATSPERDQ86XM0 798 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 OR5P3Q8WZ94 311 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RORBQ92753 470 aa12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CSAG1-202ENST00000370287 LGALS12Q96DT0 336 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms