RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320054.4

PRPF18-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF18, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 TECTBQ96PL2 329 aa11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CKLFQ9UBR5 152 aa11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 POU2F3Q9UKI9 436 aa11.66□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 A0A1W2PPK0 400 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CCDC160A6NGH7 325 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 A6NNC1 897 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 E7EQL1 145 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 H3BMQ9 156 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 PLAUP00749 431 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 SRMP19623 302 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 MYL9P24844 172 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 GNALP38405 381 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 MTNR1BP49286 362 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 EVX1P49640 407 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 SELENOVP59797 346 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 ADIPOQQ15848 244 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 MOGQ16653 247 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CLVS2Q5SYC1 327 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 ASPHD2Q6ICH7 369 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 TPRA1Q86W33 373 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CHST5Q9GZS9 411 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 SLITRK2Q9H156 845 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 ABCB9Q9NP78 766 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRPF18-201ENST00000320054 A0A1B0GWJ7 208 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 FAM221AA4D161 298 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 TRIM64BA6NI03 449 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PRSS12P56730 875 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 VBP1P61758 197 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 NCS1P62166 190 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 VHLLQ6RSH7 139 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 USP43Q70EL4 1123 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 OR8G5Q8NG78 346 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 DHRS9Q9BPW9 319 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 SLC22A4Q9H015 551 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 RNF167Q9H6Y7 350 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 DUSP13Q9UII6 198 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 FZR1Q9UM11 496 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 MPC1Q9Y5U8 109 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa11.64□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 SHISA3A0PJX4 238 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 MEGF11A6BM72 1044 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 A6NIN4 97 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 SULT1B1O43704 296 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 GMDSO60547 372 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 NRASP01111 189 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 IL1AP01583 271 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ALDOBP05062 364 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 OR4A8P0C604 315 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ATF1P18846 271 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 RAB3AP20336 220 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PPP3R1P63098 170 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PRDX4Q13162 271 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 EFNB3Q15768 340 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 LRP11Q86VZ4 500 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PIGCQ92535 297 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 NEUROG1Q92886 237 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 ORAI1Q96D31 301 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PLK3Q9H4B4 646 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 NEK6Q9HC98 313 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 GPR160Q9UJ42 338 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 COL12A1Q99715 3063 aa11.63□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.62□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 A1L4Q6 167 aa11.62□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 PDCD5O14737 125 aa11.62□□□□□ -0.55
PRPF18-201ENST00000320054 LILRA1O75019 489 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms