RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315965.6

CCDC71L-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71 like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC71L, Length 1,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71L-201ENST00000315965 TPK1Q9H3S4 243 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 KCNN3Q9UGI6 736 aa20.62■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 MAS1P04201 325 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB3AP20336 220 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 RAB3BP20337 219 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 FABP6P51161 128 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM42Q69YG0 159 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF529Q6P280 563 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 KRT74Q7RTS7 529 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 LRRTM1Q86UE6 522 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 OR1M1Q8NGA1 313 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 CA10Q9NS85 328 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PLCE1Q9P212 2302 aa20.61■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 DEFB108AA8MXU0 73 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SULT1B1O43704 296 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF250P15622 560 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 KITLGP21583 273 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 BHLHE23Q8NDY6 225 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PIGTQ969N2 578 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF442Q9H7R0 627 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 FZR1Q9UM11 496 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 CMAHPQ9Y471 501 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 MEGF11A6BM72 1044 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 IQCF6A8MYZ5 107 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SHISA9B4DS77 424 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SIAH2O43255 324 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 GMDSO60547 372 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 CST4P01036 141 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 NRASP01111 189 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 BDKRB2P30411 391 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 OR51A2Q8NGJ7 313 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PIGCQ92535 297 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PIK3IP1Q96FE7 263 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 TECTBQ96PL2 329 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM138Q9NPI0 162 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 VSTM5A8MXK1 200 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ALX3O95076 343 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 PSMD7P51665 324 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SELENOVP59797 346 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 UBE2V2Q15819 145 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 CEP78Q5JTW2 689 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 OR5AS1Q8N127 324 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 NKAIN3Q8N8D7 197 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 GPR173Q9NS66 373 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 DUSP13Q9UII6 198 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC71L-201ENST00000315965 SMIM30A4D0T7 59 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC18AA5D8T8 446 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 ADRA2CP18825 462 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 ATF1P18846 271 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 SOX6P35712 828 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 RORCP51449 518 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 MSMPQ1L6U9 139 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC18BQ6UXF7 455 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CLEC18CQ8NCF0 446 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 SLC30A2Q9BRI3 323 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 NEK6Q9HC98 313 aa20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 ZNF850A8MQ14 1090 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 PRSS44E7EML9 344 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 MAGEB3O15480 346 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 LOXP28300 417 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 OR10A3P58181 314 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 ACBD4Q8NC06 268 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 MPC1Q9Y5U8 109 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 V9GY05 133 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 NOTOA8MTQ0 251 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 NCR1O76036 304 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 IGHV3-13P01766 116 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 CAV3P56539 151 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 PRDX4Q13162 271 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 DGUOKQ16854 277 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 PLCXD3Q63HM9 321 aa20.56■□□□□ 0.88
CCDC71L-201ENST00000315965 GLT8D1Q68CQ7 371 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms