RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PGA3P0DJD8 388 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PIGPP57054 158 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 WBP2Q969T9 261 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RAB18Q9NP72 206 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.5□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PNR3 127 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 A0A1W2PQD3 144 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 HRASP01112 189 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ORM1P02763 201 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GNG3P63215 75 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 VWA2Q5GFL6 755 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 EMC6Q9BV81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 UCK1Q9HA47 277 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 H0Y8X5 98 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 FUT3P21217 361 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RFC3P40938 356 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ATP6V1FQ16864 119 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GALNT16Q8N428 558 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 HGDQ93099 445 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ERGIC1Q969X5 290 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 POM121BA6NF01 834 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CCSO14618 274 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SMIM17P0DL12 118 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 EPXP11678 715 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RAG2P55895 527 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 C1orf53Q5VUE5 145 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 LINC00596Q86U02 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 DHRS3O75911 302 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF141Q15928 474 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RAB40CQ96S21 281 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 LRP12Q9Y561 859 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PIAS2O75928 621 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SIX6O95475 246 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR5G3P0C626 314 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPS1-201ENST00000233072 HES7Q9BYE0 225 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.49□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 G3V3Q6 166 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 RAB27BO00194 218 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 MEOX1P50221 254 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 PRRX1P54821 245 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 BAP18Q8IXM2 172 aa6.48□□□□□ -1.37
CPS1-201ENST00000233072 TMEM104Q8NE00 496 aa6.48□□□□□ -1.37
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