RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222753.5

HOXA13-201, Transcript of homeobox A13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA13, Length 5,030 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-201ENST00000222753 RAB5AP20339 215 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RAB32Q13637 225 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR6S1Q8NH40 331 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PBX4Q9BYU1 374 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RANP62826 216 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF90Q03938 601 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 GHITMQ9H3K2 345 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.69■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CCR2P41597 374 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SHHQ15465 462 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZIC1Q15915 447 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LAMP3Q9UQV4 416 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 IDSB3KWA1 339 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SLC35G3Q8N808 338 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CLDN34H7C241 214 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OTPQ5XKR4 325 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SPSB1Q96BD6 273 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1W2PNR3 127 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 G3V3Y1 287 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF92Q03936 586 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF141Q15928 474 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OSR2Q8N2R0 312 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR10D4PQ8NGN7 298 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR4C3Q8NH37 302 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MARVELD3Q96A59 401 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 FAM96BQ9Y3D0 163 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.68■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CSRP3P50461 194 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ISXQ2M1V0 245 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ST3GAL6Q9Y274 331 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PGA3P0DJD8 388 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RTL8AQ9BWD3 113 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CALHM2Q9HA72 323 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 A0A1W2PPQ1 181 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 G3V3Q6 166 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 AP4M1O00189 453 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 DHHO43323 396 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CRHP06850 196 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CCR5P51681 352 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ARG2P78540 354 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LTC4SQ16873 150 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 FAM24BQ8N5W8 94 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 NECAP1Q8NC96 275 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CORO2AQ92828 525 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PTP4A1Q93096 173 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TECTBQ96PL2 329 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PSENENQ9NZ42 101 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 GPR160Q9UJ42 338 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SIT1Q9Y3P8 196 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ARID1AO14497 2285 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SPP1P10451 314 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR52N4Q8NGI2 321 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 REEP6Q96HR9 211 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 NMES1Q9C002 83 aa16.67■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ANKUB1A6NFN9 424 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CD46P15529 392 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 GSK3AP49840 483 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PPP2CBP62714 309 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 PPP2CAP67775 309 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 GPR119Q8TDV5 335 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 CRLF2Q9HC73 371 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 FOCADQ5VW36 1801 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MGST1P10620 155 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 NOXO1Q8NFA2 376 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR8U1Q8NH10 309 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 FAM221AA4D161 298 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 LANCL1O43813 399 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SDHBP21912 280 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OR1D5P58170 312 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SLC39A7Q92504 469 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 MRGPRX3Q96LB0 322 aa16.66■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 RFC3P40938 356 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 AARDQ4LEZ3 155 aa16.65■□□□□ 0.26
HOXA13-201ENST00000222753 SHARPINQ9H0F6 387 aa16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms