RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	C5	P01031	1676 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC69	A6NI79	296 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	CPD	O75976	1380 aa		11.78	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.77	□□□□□ -0.52
SPIN3-222	ENST00000639482	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	11.77	□□□□□ -0.52	1e-6	■□□□□ 10.8
SPIN3-222	ENST00000639482	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PIGB	Q92521	554 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ALDH1L1	O75891	902 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.77	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GPT	P24298	496 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNQ4	P56696	695 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HOMER1	Q86YM7	354 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A1B0GVL5	298 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GTF3C6	Q969F1	213 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.76	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	OGFR	Q9NZT2	677 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482		A0A0G2JLW4	131 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TFCP2	Q12800	502 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.75	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HAND2	P61296	217 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	EP400	Q96L91	3159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SCRN1	Q12765	414 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.74	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM182B	Q5T319	152 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF20A	O95235	890 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF5L	O75529	589 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CYP21A2	P08686	494 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TIMM10	P62072	90 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	STX1A	Q16623	288 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HIP1	O00291	1037 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	GOLIM4	O00461	696 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	ATG3	Q9NT62	314 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	REST	Q13127	1097 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	HLF	Q16534	295 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	FEZ1	Q99689	392 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
SPIN3-222	ENST00000639482	MTX1	Q13505	466 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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