RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF4Q96M43 638 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 RGS22Q8NE09 1264 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SYKP43405 635 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF131P52739 623 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ATP2B2Q01814 1243 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 GNA11P29992 359 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ABTB2Q8N961 1025 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC51Q96ER9 411 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PIK3R4Q99570 1358 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 C6orf50Q9HD87 102 aa7.17□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MUM1L1Q5H9M0 696 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.17□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.17□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 SH2D4AQ9H788 454 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 LIN9Q5TKA1 542 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SKILP12757 684 aa7.16□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ESR2Q92731 530 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.16□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 KAT14Q9H8E8 782 aa7.16□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 C9orf84Q5VXU9 1444 aa7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MCUR1Q96AQ8 359 aa7.16□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 PLCD1P51178 756 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 NBPF8Q3BBV2 869 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PCK1P35558 622 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 HOOK2Q96ED9 719 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ABCD1P33897 745 aa7.15□□□□□ -1.26
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SCN2A-209ENST00000636071 MAN1A1P33908 653 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 STAT6P42226 847 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 PAK2Q13177 524 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 TEKT1Q969V4 418 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 GRIN2BQ13224 1484 aa7.15□□□□□ -1.26
SCN2A-209ENST00000636071 BTBD11A6QL63 1104 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 CBX1P83916 185 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 PRDM2Q13029 1718 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 POTEB3A0JP26 581 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 INPP5BP32019 993 aa7.15□□□□□ -1.27
SCN2A-209ENST00000636071 POTEBQ6S5H4 581 aa7.15□□□□□ -1.27
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