RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635562.1

PSPC1-208, Transcript of paraspeckle component 1, human

TSL 3

Gene PSPC1, Length 422 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	RGS22	Q8NE09	1264 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562		J3QW42	95 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	IRAK1	P51617	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	HYAL2	Q12891	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	COX20	Q5RI15	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	OR13H1	Q8NG92	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SSTR4	P31391	388 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ALX3	O95076	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	CDC27	P30260	824 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	MTMR3	Q13615	1198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562		H3BRB1	525 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	KIF4A	O95239	1232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ABL1	P00519	1130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	NFIA	Q12857	509 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ACAD11	Q709F0	780 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	WNT8B	Q93098	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	PTPRA	P18433	802 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	MPST	P25325	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	CABP4	P57796	275 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FSCN2	O14926	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM13A	O94988	1023 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ZAP70	P43403	619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	RNF43	Q68DV7	783 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	STIM2	Q9P246	746 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PSPC1-208	ENST00000635562	ZBTB39	O15060	712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	FZD6	O60353	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	TGFB1	P01137	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	IGHA2	P01877	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ERCC3	P19447	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ATP11A	P98196	1134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PSPC1-208	ENST00000635562	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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