RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 APOBRQ0VD83 1088 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 CAPN2P17655 700 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 TUBB4AP04350 444 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 CHST3Q7LGC8 479 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 A0A1W2PRG0 241 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 IKBKGQ9Y6K9 419 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RUFY3Q7L099 469 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PLCD3Q8N3E9 789 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 IGSF3O75054 1194 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM75PA6NK02 468 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NAPAP54920 295 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 FBF1Q8TES7 1133 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 OPA1O60313 960 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 ACTN2P35609 894 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PLVAPQ9BX97 442 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 KRT83P78385 493 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 MSL1Q68DK7 614 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 TSPYL6Q8N831 410 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NBPF4Q96M43 638 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 GNAQP50148 359 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PPM1EQ8WY54 764 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 C10orf67Q8IYJ2 551 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 DDX12PQ92771 950 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RASSF4Q9H2L5 321 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 KRT13P13646 458 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 KRT2P35908 639 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 CEP57Q86XR8 500 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 HS1BP3Q53T59 392 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 IFNKQ9P0W0 207 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 VAMP4O75379 141 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RFC4P35249 363 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 CAPZA3Q96KX2 299 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 RTL9Q8NET4 1388 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.2■■□□□ 1.47
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 UBXN1Q04323 297 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 USP26Q9BXU7 913 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 OGFRQ9NZT2 677 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 SEC24BO95487 1268 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 NUP160Q12769 1436 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 KRT86O43790 486 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CHMLP26374 656 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 STX17P56962 302 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC6Q16204 474 aa24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ARID5AQ03989 594 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 RGS22Q8NE09 1264 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ST5P78524 1137 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 KIF5AQ12840 1032 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 FERMT1Q9BQL6 677 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 TSNARE1Q96NA8 513 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.19■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 TFCP2Q12800 502 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 GUCA1BQ9UMX6 200 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CALM1P0DP23 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CALM2P0DP24 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CALM3P0DP25 149 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 POLKQ9UBT6 870 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.18■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 KIF4AO95239 1232 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 PRPHP41219 470 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 NGLY1Q96IV0 654 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 SYNCQ9H7C4 482 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 EBAG9O00559 213 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf50Q9HD87 102 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 BRAPQ7Z569 592 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC42Q96M95 316 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTPRM-211ENST00000580170 USP37Q86T82 979 aa24.17■■□□□ 1.46
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