RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 KLRK1P26718 216 aa37.03■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD44Q8N8A2 993 aa37.03■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 TRAF5O00463 557 aa37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 TAF5LO75529 589 aa37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 DACT2Q5SW24 774 aa37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 STRIP1Q5VSL9 837 aa37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
RAB40C-211ENST00000568586 RASSF10A6NK89 507 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 KCNJ4P48050 445 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 TAF7LQ5H9L4 462 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 CST9Q5W186 159 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 CDC37L1Q7L3B6 337 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 ARHGAP45Q92619 1136 aa37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 A0A1B0GUL6 1792 aa36.99■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.99■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 CNNM1Q9NRU3 951 aa36.99■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 SNAP23O00161 211 aa36.98■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP36.97■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 USP17L8P0C7I0 530 aa36.97■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa36.97■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa36.96■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 CD209Q9NNX6 404 aa36.96■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 TRPM7Q96QT4 1865 aa36.96■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.95■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 KIF16BQ96L93 1317 aa36.95■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 MMP14P50281 582 aa36.95■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.95■■■■□ 3.51
RAB40C-211ENST00000568586 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 VEGFBP49765 207 aa36.92■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 UBE4AQ14139 1066 aa36.92■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.92■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36.92■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 IL1R1P14778 569 aa36.91■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.91■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 MROH5Q6ZUA9 1318 aa36.9■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 USP48Q86UV5 1035 aa36.9■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 MXD3Q9BW11 206 aa36.9■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 TLL2Q9Y6L7 1015 aa36.9■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF804AQ7Z570 1209 aa36.89■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
RAB40C-211ENST00000568586 CELF2O95319 508 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 KRT26Q7Z3Y9 468 aa36.88■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 PLIN1O60240 522 aa36.87■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 GTF2IP78347 998 aa36.87■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 SCARF1Q14162 830 aa36.86■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC24Q50LG9 513 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 SAPCD2Q86UD0 394 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 OGFOD1Q8N543 542 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 VGLL2Q8N8G2 317 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 GGA3Q9NZ52 723 aa36.85■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
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RAB40C-211ENST00000568586 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 HHIPL1Q96JK4 782 aa36.84■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 HDAC5Q9UQL6 1122 aa36.84■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa36.84■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 FBXW7Q969H0 707 aa36.83■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.83■■■■□ 3.49
RAB40C-211ENST00000568586 BCAR3O75815 825 aa36.82■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 SASH1O94885 1247 aa36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 DLK2Q6UY11 383 aa36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 SULF1Q8IWU6 871 aa36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 KLHDC4Q8TBB5 520 aa36.81■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
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RAB40C-211ENST00000568586 ADM5C9JUS6 153 aa36.8■■■■□ 3.48
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RAB40C-211ENST00000568586 TRIM27P14373 513 aa36.8■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
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RAB40C-211ENST00000568586 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 METTL24Q5JXM2 366 aa36.79■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa36.79■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 FAM205AQ6ZU69 1335 aa36.79■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
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RAB40C-211ENST00000568586 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.78■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 MEIS3Q99687 375 aa36.78■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 FBXO3Q9UK99 471 aa36.78■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 EYA2O00167 538 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 WNT10BO00744 389 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 ECE1P42892 770 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 FBXO33Q7Z6M2 555 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 CAPNS2Q96L46 248 aa36.77■■■■□ 3.48
RAB40C-211ENST00000568586 HDAC9Q9UKV0 1011 aa36.77■■■■□ 3.48
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