RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 PDE8AO60658 829 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 OSBPP22059 807 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 MMRN1Q13201 1228 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 PRR5LQ6MZQ0 368 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SLC51AQ86UW1 340 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 NLGN1Q8N2Q7 840 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 CNBD1Q8NA66 436 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 GREM2Q9H772 168 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 NUP98P52948 1817 aa7.55□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 AAMPQ13685 434 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SSH3Q8TE77 659 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SYT17Q9BSW7 474 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 NYXQ9GZU5 481 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 PARP3Q9Y6F1 533 aa7.54□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 HMMRO75330 724 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 ITGA6P23229 1130 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 ST5P78524 1137 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 MTX1Q13505 466 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 LRRC24Q50LG9 513 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 EPAS1Q99814 870 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 C10orf71Q711Q0 1435 aa7.52□□□□□ -1.2
GINS3-210ENST00000568468 COL4A1P02462 1669 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ARHGAP33O14559 1287 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CSF1RP07333 972 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NLRP3Q96P20 1036 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 LNPKQ9C0E8 428 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 DCTPP1Q9H773 170 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.52□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CHRNA5P30532 468 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RGS3P49796 1198 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 SLC10A5Q5PT55 438 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 SMC5Q8IY18 1101 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.51□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 SNAP23O00161 211 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 SASH1O94885 1247 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NUCB1Q02818 461 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TFCP2Q12800 502 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 DDX12PQ92771 950 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 FBXW7Q969H0 707 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 GCC1Q96CN9 775 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.5□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 EYA2O00167 538 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
GINS3-210ENST00000568468 COPRSQ9NQ92 184 aa7.49□□□□□ -1.21
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