RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 UBE4AQ14139 1066 aa22.8■■□□□ 1.24
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INO80E-211ENST00000567987 BECN1Q14457 450 aa22.79■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.79■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.79■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 A0A0D9SFI3 127 aa22.78■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.78■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 BCAMP50895 628 aa22.78■■□□□ 1.24
INO80E-211ENST00000567987 SLC51AQ86UW1 340 aa22.78■■□□□ 1.24
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INO80E-211ENST00000567987 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.73■■□□□ 1.23
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INO80E-211ENST00000567987 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
INO80E-211ENST00000567987 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
INO80E-211ENST00000567987 MED23Q9ULK4 1368 aa22.72■■□□□ 1.23
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INO80E-211ENST00000567987 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.7■■□□□ 1.23
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INO80E-211ENST00000567987 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.222e-7■■■□□ 15.2
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INO80E-211ENST00000567987 TMC4Q7Z404 712 aa22.67■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 WASHC4Q2M389 1173 aa22.66■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 SP8Q8IXZ3 490 aa22.66■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 H0YIN7 160 aa22.65■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 OSBP2Q969R2 916 aa22.65■■□□□ 1.22
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INO80E-211ENST00000567987 M0R2C6 588 aa22.65■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 UFL1O94874 794 aa22.65■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 ANAPC15P60006 121 aa22.65■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 27.6
INO80E-211ENST00000567987 GGA1Q9UJY5 639 aa22.65■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.64■■□□□ 1.22
INO80E-211ENST00000567987 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
INO80E-211ENST00000567987 ATP2B4P23634 1241 aa22.64■■□□□ 1.21
INO80E-211ENST00000567987 ADD2P35612 726 aa22.64■■□□□ 1.21
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