RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549		H7C1D1	291 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TAF5L	O75529	589 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	GNAI3	P08754	354 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MS4A1	P11836	297 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	KLRK1	P26718	216 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	MED23	Q9ULK4	1368 aa		15.46	■□□□□ 0.07
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TRAF5	O00463	557 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	EGFR	P00533	1210 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PODN	Q7Z5L7	613 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PSME4	Q14997	1843 aa		15.45	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	JMY	Q8N9B5	988 aa		15.44	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L3	A6NCW0	530 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L4	A6NCW7	530 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PLIN1	O60240	522 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GML	Q99445	158 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	MXD3	Q9BW11	206 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GUL6	1792 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		15.43	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	KCNJ4	P48050	445 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	DLK2	Q6UY11	383 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	COA1	Q9GZY4	146 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		15.42	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	DACT2	Q5SW24	774 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CST9	Q5W186	159 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	FBXW7	Q969H0	707 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	FBXO3	Q9UK99	471 aa		15.41	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	USP48	Q86UV5	1035 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	MEIS3	Q99687	375 aa		15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
RBM23-231	ENST00000557549	CNTNAP1	P78357	1384 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	USP17L8	P0C7I0	530 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MTX1	Q13505	466 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	LRRC24	Q50LG9	513 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CD209	Q9NNX6	404 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	TNN	Q9UQP3	1299 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		15.39	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF609	O15014	1411 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GNAI2	P04899	355 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	VEGFB	P49765	207 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	GTF2I	P78347	998 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PCNT	O95613	3336 aa		15.38	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	15.37	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	SCARF1	Q14162	830 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PDE3A	Q14432	1141 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		15.37	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	RASSF10	A6NK89	507 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ADM5	C9JUS6	153 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	RLBP1	P12271	317 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	UBE4A	Q14139	1066 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		15.36	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	CIAO1	O76071	339 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	IL1R1	P14778	569 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		15.35	■□□□□ 0.05
RBM23-231	ENST00000557549	COPRS	Q9NQ92	184 aa		15.35	■□□□□ 0.05

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