RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, human

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	SNAP23	O00161	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	MCAM	P43121	646 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ZAP70	P43403	619 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PHKA1	P46020	1223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PTH1R	Q03431	593 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	MYH7	P12883	1935 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	CHGB	P05060	677 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRR-208	ENST00000549107	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	GRAP	Q13588	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CRY2	Q49AN0	593 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ST18	O60284	1047 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	BCAM	P50895	628 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RASGRF1	Q13972	1273 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	KCNB2	Q92953	911 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MAST3	O60307	1309 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	KCNJ4	P48050	445 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107		M0R2C6	588 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MMP10	P09238	476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ADD2	P35612	726 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	BAG6	P46379	1132 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	GYG1	P46976	350 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	NEK4	P51957	841 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	APPBP2	Q92624	585 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLC27A2	O14975	620 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	KLRK1	P26718	216 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	MSL1	Q68DK7	614 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
PTPRR-208	ENST00000549107	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25

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