RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546141.5

GLI1-208, Transcript of GLI family zinc finger 1, human

TSL 5 BASIC

Gene GLI1, Length 3,475 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLI1-208	ENST00000546141	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CYP2C19	P33261	490 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	SNRK	Q9NRH2	765 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	UTY	O14607	1347 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	HAND2	P61296	217 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	KRT32	Q14532	448 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	ME1	P48163	572 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CTR9	Q6PD62	1173 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	APP	P05067	770 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	ERBB3	P21860	1342 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	BECN2	A8MW95	431 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	CLGN	O14967	610 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	PHKG2	P15735	406 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TEX35	Q5T0J7	233 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GLI1-208	ENST00000546141	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	MMP14	P50281	582 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FSIP1	Q8NA03	581 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CTDNEP1	O95476	244 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CABP4	P57796	275 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	HAUS7	Q99871	368 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	USP27X	A6NNY8	438 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141		A0A1B0GVL5	298 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	BIN1	O00499	593 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CYP27B1	O15528	508 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ISM2	Q6H9L7	571 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	NPHP1	O15259	732 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141		E7EWF7	191 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	A1BG	P04217	495 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	CEP135	Q66GS9	1140 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	PFKFB2	O60825	505 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.68	□□□□□ -0.54
GLI1-208	ENST00000546141	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.68	□□□□□ -0.54

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