RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536780.6

MIR9-3HG-201, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MIR9-3HG, Length 4,778 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ARID3AQ99856 593 aa15.99■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ALG1Q9BT22 464 aa15.99■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.99■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 OGFOD1Q8N543 542 aa15.99■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CERS3Q8IU89 383 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ATP5JP18859 108 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 USP31Q70CQ4 1352 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KIF20AO95235 890 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SEC24BO95487 1268 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PDE4CQ08493 712 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.98■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DLC1Q96QB1 1528 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SYCP1Q15431 976 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 NCAPD2Q15021 1401 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 F13A1P00488 732 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.97■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FEZ1Q99689 392 aa15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GDPD2Q9HCC8 539 aa15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CFAP100Q494V2 611 aa15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
MIR9-3HG-201ENST00000536780 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ODF2Q5BJF6 829 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CCDC102BQ68D86 513 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 AMPD3Q01432 767 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BRINP3Q76B58 766 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MCM9Q9NXL9 1143 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PTCH1Q13635 1447 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 STX1AQ16623 288 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 STK32BQ9NY57 414 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MBD4O95243 580 aa15.95■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 POLD1P28340 1107 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 UBA7P41226 1012 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 WDR66Q8TBY9 1149 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CALML3P27482 149 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 UVSSAQ2YD98 709 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CALML4Q96GE6 196 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TMEM87BQ96K49 555 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 DEF6Q9H4E7 631 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ESPNB1AK53 854 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CTSWP56202 376 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 COPRSQ9NQ92 184 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SSH2Q76I76 1423 aa15.94■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 RPS6KB1P23443 525 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TTC6Q86TZ1 520 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ATL3Q6DD88 541 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CAGE1Q8TC20 777 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TSG101Q99816 390 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SLC27A2O14975 620 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.93■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 GGA1Q9UJY5 639 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SIK1P57059 783 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 BRAPQ7Z569 592 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 TM6SF1Q9BZW5 370 aa15.92■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 MAST3O60307 1309 aa15.91■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 UFL1O94874 794 aa15.91■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 APOBRQ0VD83 1088 aa15.91■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.91■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MIR9-3HG-201ENST00000536780 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms