RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534610.5

ATG13-222, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 5

Gene ATG13, Length 1,655 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-222	ENST00000534610	KIF2C	Q99661	725 aa		18.51	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	TAF5L	O75529	589 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	KLHL34	Q8N239	644 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ST18	O60284	1047 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC102B	Q68D86	513 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	FAM227B	Q96M60	508 aa		18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	KCNJ4	P48050	445 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		18.49	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	HSPA4	P34932	840 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	18.48	■□□□□ 0.55	7e-7	■■■□□ 18.5
ATG13-222	ENST00000534610	IL25	Q9H293	177 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		18.48	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610		A0A0D9SFI3	127 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ZAP70	P43403	619 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		18.47	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	SPEF2	Q9C093	1822 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	PHKA1	P46020	1223 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	GRAP	Q13588	217 aa		18.46	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
ATG13-222	ENST00000534610	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MCAM	P43121	646 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RNF20	Q5VTR2	975 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MAP4K1	Q92918	833 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		18.45	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	YY1	P25490	414 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	IL17RA	Q96F46	866 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PTH1R	Q03431	593 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	DDR1	Q08345	913 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SCARF1	Q14162	830 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SPATA5	Q8NB90	893 aa		18.44	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MED23	Q9ULK4	1368 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MCM2	P49736	904 aa		18.43	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	BCAM	P50895	628 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NEK4	P51957	841 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SNAP23	O00161	211 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	BBOX1	O75936	387 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CRY2	Q49AN0	593 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PALD1	Q9ULE6	856 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MMP10	P09238	476 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	MAP3K12	Q12852	859 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	NECTIN1	Q15223	517 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PSMA5	P28066	241 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	PI16	Q6UXB8	463 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	APPBP2	Q92624	585 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-222	ENST00000534610	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	PDE6B	P35913	854 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	KCNB2	Q92953	911 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-222	ENST00000534610	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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